DDBJで提供している FASTA, BLAST, PSI-BLAST, SSEARCH の 相同性検索サービスが改良されました。 6月19日に,BLAST 用の検索サーバを拡充し,高速化に成功しました。 同時に,WWW 画面も更新して使いやすさも向上しました。
また,DDBJ データベースを対象に検索を行なう場合,EST 等の配列が検索対象外になりました。 これまでデフォルトでは「すべての DNA 配列データ」を対象に検索していましたが, 今回の変更により EST, HTG, GSS, STS, SYN, UNA の division が検索対象から除かれます。 これによって,十分にアノテーションされた DNA 配列の情報を効率よく検索できるようになりました。 もちろん,これまで通り「すべての DNA 配列データ」を選択することも可能です。 以上の変更によって相同性検索の速度が向上しておりますので,ぜひお試しください。