ＤＤＢＪではDDBJ/EMBL/GenBank 国際 DNA データバンクの構築規範に沿って塩基配列データを管理し，データベースとして公開しています。 データベースは毎日更新されており，9月25日に総塩基数が100億 bp を越えました。
2000年09月25日現在ＤＤＢＪから公開された
総塩基数 : 10,006,156,465 bp ，エントリー数 : 8,614,133