ＤＤＢＪでは2000年12月より WWW で SQmatch (matching a regular expression against sequences in Database) を公開しました。 SQmatch は UNIX コマンドの grep のように遺伝子配列への正規表現によるパターンマッチを行なうことが出来るため， FASTA/BLAST では処理できない短い断片や “N” を含む配列の検索に有効です。
URL は http://ftp2.ddbj.nig.ac.jp:8080/sqmatch_ja.html で， ＤＤＢＪのホームページ「データベース検索および解析」ページからリンクが張られています。 どうぞご利用下さい。