国立遺伝学研究所（静岡県三島市，所長代行：小原雄治，以下 遺伝研）と 富士通株式会社（代表取締役社長：黒川博昭，以下 富士通）は，次世代データベースシステムを共同で開発研究し，バイオ分野のデータベース技術における世界のデファクトスタンダード化を目指すことで合意しました。
遺伝研の生命情報・DDBJ 研究センター（センター長：五條堀孝，以下 DDBJ）は，欧州の分子生物学研究所 (EMBL) と米国の国立バイオテクノロジー情報センター (NCBI) とともに三大国際 DNA データベースを運用しております。 ポストゲノム時代を迎えてデータベースそのもの，およびデータベースの開発・運用技術の重要性はますます高まっています。
DDBJ が扱うデータ量はすでに3500万件，398億塩基に上り，２年で２倍以上の勢いで増加しています。 このような状況下で一日一万件以上のアクセスに対応するため，データベース検索の高速化が目下の大きな課題となっています。
今回共同開発するシステムは，富士通製の XML データベース検索システム「インターステージシュンサク（Interstage Shunsaku）」を基盤技術として採用し，この発表に先立って開発したプロトタイプでは，既に現行システムと比べて100倍以上の高速性を実現しています。
富士通と DDBJ は，先進情報技術を必要とするバイオ分野を大規模で複雑なデータ処理技術の格好の実践的試験の場として捉え，次世代バイオデータベースシステムを共同で研究開発していきます。
なお，このシステムのプロトタイプ版は，DDBJ を通じて，本年中に全世界に向けて一般公開する予定です。