getentry (get-entry@nig.ac.jp) は DDBJ が web サーバと E-mail サーバで提供するアクセッション番号などによるエントリ検索システムです。
結果出力を複数の形式から選択することができますが,そのうちの1つである「フラットファイル (EMBL)」は利用者が少ないため2006年1月16日に廃止することになりました。
この「フラットファイル (EMBL)」は検索対象として「DNA データベース」を選択した場合に使用可能な出力形式の1つでしたが,今後は以下の形式より選択してご利用下さい。
DNA データベースを選択した場合
フラットファイル(DDBJ):DDBJ のデータ公開形式で出力
- 全塩基配列 FASTA:塩基配列の全長を FASTA 形式で出力
- CDS アミノ酸配列FASTA:各 CDS 領域のアミノ酸翻訳配列を FASTA 形式で出力
- CDS 塩基配列 FASTA:各 CDS 領域の塩基配列をFASTA 形式で出力
- Quality Value:HTG および HTC の一部データで提供されている Phrap 値を表示
- DDBJ-XML:DDBJ が設計した XML 形式(DDBJ-XML)で出力
- INSD-XML:INSD が共通で使用する DTD により設計したXML 形式で出力
Protein データベース(UniProt, PDB, DAD, PRF, Patent)を選択した場合
- default:指定したデータベースの公開形式で出力
- アミノ酸配列 FASTA:アミノ酸配列を FASTA 形式で出力
- 塩基配列 FASTA (for DAD):アミノ酸配列をコードする塩基配列を FASTA 形式で出力