Nucleic Acids Research では,毎年1月1日にデータベース特集号が発行されています。
本年1月1日発行の Vol. 34, Database Issue に,DDBJ の活動ならびにDDBJ の運営するデータベースを紹介する下記の論文が掲載されました。
  • DDBJ の活動の紹介
    "DDBJ in preparation for overview of research activities behind data submissions."
    Kousaku Okubo, Hideaki Sugawara, Takashi Gojobori and Yoshio Tateno
    Nucleic Acids Research, 2006, Vol. 34, Database issue D6-D9
    (内容)INSDC の結成,新規データベースの公開等の活動報告。特に,INSDC に登録されたデータの詳細な分析内容が "Breakdown Statistics"(統計の詳細)として DDBJ HP 上で公開されたことが詳しく記載されています。
    (PMID: 16381940)
  • 新規データベース:BodyMap の紹介
    "BodyMap-Xs: anatomical breakdown of 17 million animal ESTs for
    cross-species comparison of gene expression."

    Osamu Ogasawara, Makiko Otsuji, Kouji Watanabe, Takayasu Iizuka,
    Takuro Tamura, Teruyoshi Hishiki, Shoko Kawamoto, and Kousaku Okubo
    BodyMap-Xs: anatomical breakdown of 17 million animal ESTs for
    cross-species comparison of gene expression
    Nucleic Acids Research, 2006, Vol. 34, Database issue D628-D631
    (内容)BodyMap-Xs は組織や細胞ごとの遺伝子発現データベースで,EST データを基に作成されています。
    (PMID: 16381946)
  • 新規データベース:RAP-DB の紹介
    "The Rice Annotation Project Database (RAP-DB): hub for Oryza sativa
    ssp. japonica genome information."

    Hajime Ohyanagi, Tsuyoshi Tanaka, Hiroaki Sakai, Yasumasa Shigemoto,
    Kaori Yamaguchi, Takuya Habara, Yasuyuki Fujii, Baltazar A. Antonio,
    Yoshiaki Nagamura, Tadashi Imanishi, Kazuho Ikeo, Takeshi Itoh, Takashi
    Gojobori, and Takuji Sasaki
    Nucleic Acids Research, 2006, Vol. 34, Database issue D741-D744
    (内容)RAP-DB は、国際イネゲノム解読プロジェクトの成果に基づくイネの高精度アノテーション情報を収録したデータベースで,昨年12月に 公開されました。

    (PMID: 16381971)