DDBJ の相同性検索では検索対象ディビジョンの指定が可能で，さらに EST については，登録数の多いものから生物種を選択して指定することができます （DDBJ 全データ，DDBJ 新着データ選択時に有効）。 2004年に，その EST の１つである Silurana tropicalis について，生物名が Xenopus tropicalis に変更されたました。しかしながら，データ作成処理および検索ページ表記変更に漏れがあり，S. tropicalis のままとなっていたため，相同性検索実行時に EST の X. tropicalis ディビジョン指定での検索ができず，S. tropicalis ディビジョンを指定した場合には正しく検索が行われませんでした。詳細は以下の通りです。
- 期間：2004年7月より2006年1月20日まで
- 影響のあったサービス：PSI-BLAST を除く相同性検索の全サービス（WWW，E-mail とも）
- 状況：検索対象ディビジョンとして EST の S. tropicalis ディビジョンを指定して検索を行なってもヒットしない（EST division を「select-all」または「上記以外」を指定した場合にはヒットした）。
- 対応：データ作成処理および検索ページの表記を修正し，現在は正しい検索結果が得られます。
なお，今後の防止対策として，データのチェックシステムを導入する予定です。
正しい検索ができない状況が長期間にわたって続いていたことにより，ユーザの皆様に多大なご迷惑をお掛けいたしましたことを深くお詫び申し上げます。