１．検索プログラムバージョンアップ
| サービス | Ver.up前 | Ver.up後 | ||
| BLAST | 2.2.12 | -> | 2.2.13 | |
| PSI-BLAST | 2.2.12 | -> | 2.2.13 | |
| FASTA | 34t21 | -> | 34t25 | |
| SSEARCH | 34t21 | -> | 34t25 |
このバージョンアップにともない，FASTA と SSEARCH の検索結果の identity に関する表記が ungapped の 値から similar の値を表示する形式に変更されました。
- identity=完全一致でヒットした数/相同性があると判断された領域全体の数（ギャップ座位を含む）
- ungapped=完全一致でヒットした数/相同性があると判断された領域全体の数（ギャップ座位を含まない）
- similar=類似のアミノ酸を含めヒットした数/相同性があると判断された領域全体の数（ギャップ座位を含む）
バージョンアップ前の形式>>sp|P94604|GYRB_CLOAB DNA gyrase subunit B (EC 5.99.1.3 (637 aa) initn: 178 init1: 116 opt: 185 Z-score: 272.1 bits: 57.1 E(): 5.2e-08Smith-Waterman score: 185; 55.932% identity (61.111% ungapped) in 59 aa overlap (1-58:167-221) 10 20 30query TTTHFVPDPEIFTETIEFDYDTLANRVREL : .: :::::: .: :.:::::..:.:::sp|P94 KTEGHIWKQTYHRGKVASPFEKIGDSDEHGTKIYFKPDPEIFEDT-EYDYDTLSQRLREL 140 150 160 170 180 190 40 50query AFLTKGVNIIIEDLREGKERKNE-YCYEG :::.::..: . : :. ::: . :::sp|P94 AFLNKGIKIELTDERHD---KNEIFHYEGGLKSFVSYLNRNKEVVFKEPIYVEGSIDSNY 200 210 220 230 240 250バージョンアップ後の形式>>sp|P94604|GYRB_CLOAB DNA gyrase subunit B (EC 5.99.1.3 (637 aa) initn: 178 init1: 116 opt: 185 Z-score: 271.6 bits: 57.0 E(): 5.5e-08Smith-Waterman score: 185; 55.932% identity (76.271% similar) in 59 aa overlap (1-58:167-221) 10 20 30query TTTHFVPDPEIFTETIEFDYDTLANRVREL : .: :::::: .: :.:::::..:.:::sp|P94 KTEGHIWKQTYHRGKVASPFEKIGDSDEHGTKIYFKPDPEIFEDT-EYDYDTLSQRLREL 140 150 160 170 180 190 40 50query AFLTKGVNIIIEDLREGKERKNE-YCYEG :::.::..: . : :. ::: . :::sp|P94 AFLNKGIKIELTDERHD---KNEIFHYEGGLKSFVSYLNRNKEVVFKEPIYVEGSIDSNY 200 210 220 230 240 250２．web ページの画面レイアウト変更
検索配列データを指定する際には「検索配列データ」欄のテキストボックスかファイルアップロード機能を利用します。これまではこの欄がページ下部にありましたが，使いやすさを考慮して上部に移動しました。
３．Safariへの対応
FASTA，PSI-BLAST の結果表示画面の Safari への対応が完了しました。