DDBJ が管理・収集している塩基配列データベースは,「DDBJ・DAD リリース」として定期的に年4回オンライン上で公開しています。 また,最新の DDBJ・DAD 定期リリースの締め日以降に公開されたデータは,「DDBJ・DAD 新着データ」として毎日公開されています。「DDBJ・DAD 定期リリース」ならびに「DDBJ・DAD 新着データ」の FASTA 形式に変更をおこないました。詳細は以下のとおりです。:DDBJ リリースデータをもとにしたアミノ酸配列データベース変更のあったデータの種類 (全て anonymous FTP にて取得可能)
データの種類 変更内容 適用範囲
ddbj,ddbjnew/fasta 大文字 → 小文字 変換 DDBJ 定期リリース83 ならびに
DDBJ 定期リリース83締め日以降の新着データより
ddbj,ddbjnew/cdsdb エントリ末尾の「//」を削除
dad,dadnew/fasta DAD 定期リリース53 ならびに
DAD 定期リリース53締め日以降の新着データより
以下のサービスにも変更が生じました。
データベースの種類 変更内容 適用範囲
getentry
DNA データベース
CDS アミノ酸配列 FASTA エントリ末尾の「//」を削除 DDBJ 定期リリース83 締め日以降
CDS 塩基配列 FASTA
PROTEIN データベース
アミノ酸配列 FASTA エントリ末尾の「//」を削除 DAD 定期リリース53締め日以降
塩基配列 FASTA (for DAD)
 
supernig
ddbj,ddbjnew/fasta 大文字 → 小文字 変換 DDBJ 定期リリース83ならびに
DDBJ 定期リリース83締め日以降の新着データより
dad/fasta エントリ末尾の「//」を削除 DAD 定期リリース53より