日本特許庁(JPO) と韓国特許庁(KIPO) に由来する配列データにおいて, フラットファイルのDEFINITION 行の先頭に特許公報番号と配列番号を付加する修正を実施しました。

DEFINITION 行の修正例
(Old format)
DEFINITION Genetic Makers Expressed in Tumors.

(New format)
DEFINITION JP 2010599999-A/1: Genetic Makers Expressed in Tumors.


修正後のデータは,以下で取得が可能です。
(塩基配列データ)
DDBJ リリース85.0 で公開しています。 塩基配列データの修正後の内容は順次,getentry,ARSA,BLAST では修正データが反映される予定です。
Patent file name: ddbjpat.seq.gz
: file number

(アミノ酸配列データ)
DDBJ anonymous FTP サイトで公開しています。 アミノ酸配列データは,getentry,BLAST で修正データが反映されています。
JPO ファイル: jpo_ddbj_aa.seq.gz
KIPO ファイル: kipo_ddbj_aa.seq.gz