ClustalW は,DNA 配列やタンパク質配列の多重整列のためのツールです。
通常版(Version 2.1)に加え,DDBJ 拡張版(Version 1.83, Modified by Dr. Kirill Kryukov) を追加しました。

Version で "1.83" を選択頂くと,系統樹作成・BOOTSTRAP の詳細なオプション指定が可能になります。
詳しくは,ClustalW ヘルプの DDBJ 拡張版(Version 1.83, Modified by Dr. Kirill Kryukov) のオプション をご参照ください。