DDBJでは、日本特許庁(Japan Patent Office: JPO)と韓国特許庁(Korean Intellectual Property Office: KIPO)から転送されたアミノ酸配列データの公開を行っています。
各特許庁ごとにまとめられたアミノ酸配列データについては、以下のサイトから蓄積ファイルとして一括取得が可能です。
ftp://ftp.ddbj.nig.ac.jp/ddbj_database/patent/

2014年12月より、蓄積ファイルの更新タイミングが3か月ごとから、データ公開時に変更されました。
各データの更新タイミングは、以下となります。
 [1] JPOデータ (月に1-2回)
 [2] KIPOデータ (年に2回)
 [3] JPO/KIPOデータ更新/その他データ処理 (不定期)

アミノ酸配列データの取得は蓄積ファイルの他に、getentryでのアクセッション番号検索、ARSAでのキーワード検索が可能です。