ArrayExpress データの ftp ミラーサイトは2022年9月9日に閉鎖いたしました。

DDBJ センターは European Bioinformatics Institute (EBI) ArrayExpress チームとの国際協力に基づき，ArrayExpress (array, experiment と atlas) 全公開データをダウンロードし ftp ミラーサイトの提供を開始いたしました (RNA-seq データが格納されている atlas 下の rnaseq ディレクトリを除く)。ミラーリングはライフサイエンス統合データベースセンター (DBCLS) 坊農 秀雅 特任准教授の協力により実施されました。

ftp アドレス

公開データは 50 テラバイトに及ぶ容量であったため EBI からのダウンロードには高速ファイル転送ソフト aspera を利用し，ミラーリングは坊農 特任准教授が作成したプログラムを国立遺伝学研究所スーパーコンピュータシステムで実行することにより実施されました。

今回の DDBJ センター，EBI ArrayExpress チーム，DBCLS との協力により実現したミラーリングにより，日本国内及び近隣諸国のユーザはネットワークが近い DDBJ センターのスパコンから ArrayExpress データをダウンロードすることができるようになります。