新しい BioProject/BioSample/SRA 新検索システム (ベータ版) をリリースいたしました。
https://ddbj.nig.ac.jp/search

JGA のデータのみを対象にしていましたが、INSDC (NCBI/EBI/DDBJ Center) から公開されている BioProject/BioSample/SRA データを対象に追加いたしました。
最新のデータは取り込まれていません。

左の Select type で対象データを絞り込むことができます。
対象データの種類とアクセッション番号プレフィックスは以下になります。

  • biosample: BioSample (SAMD/SAME/SAMN)
  • sra-run: SRA Run (DRR/ERR/SRR)
  • sra-experiment: SRA Experiment (DRX/ERX/SRX)
  • sra-sample: SRA Sample (DRS/ERS/SRS)
  • sra-submission: SRA Submission (DRA/ERA/SRA)
  • bioproject: BioProject (PRJD/PRJE/PRJN)
  • sra-study: SRA Study (DRP/ERP/SRP)
  • sra-analysis: SRA Analysis (DRZ/ERZ/SRZ)
  • jga-dataset: JGA Dataset
  • jga-study: JGA Study
  • jga-policy: JGA Policy
  • jga-dac: JGA DAC

DRASearch は法定停電にあわせて実施される次回スパコンメンテナンス 2021年11月10日～11/19日 DDBJ センターの登録検索解析サービス停止のお知らせ 時に閉鎖する予定です。
閉鎖後は DRASearch へのアクセッション番号リンクは対応する新検索システムのリンクにリダイレクトされます。

Submission accession:
https://ddbj.nig.ac.jp/DRASearch/submission?acc=DRA000001 –> https://ddbj.nig.ac.jp/resource/dra-submission/DRA000001

Experiment accession:
https://ddbj.nig.ac.jp/DRASearch/experiment?acc=DRX000001 –> https://ddbj.nig.ac.jp/resource/dra-experiment/DRX000001

Run accession:
https://ddbj.nig.ac.jp/DRASearch/run?acc=DRR000001 –> https://ddbj.nig.ac.jp/resource/dra-run/DRR000001

BioProject/BioSample/SRA 新検索システムへのご意見を受け付けております　　　　

DRASearch の閉鎖までに fastq/sra ファイルのダウンロードリンクの追加等、可能な限りの機能追加を実施していく計画です。
現在 DRA のデータは NCBI 経由で取得しており、DRA ftp からの取得に切り替わるのは今年12月になる見込みです。

今後も新検索システムは改善を続けて参ります。