新しい BioProject/BioSample/SRA 新検索システムをリリースいたしました。
https://ddbj.nig.ac.jp/search

BioProject/BioSample/SRA 新検索システムへのご意見を受け付けております。　　　　

11月24日時点で NCBI SRA が作成した NCBI_SRA_Metadata_20211119.tar.gz までに含まれているデータがインデックスされております。
新検索システムは DRA から公開されたデータを NCBI dump file 経由で取得しておりますが、早急に DRA ftp から取得するように変更し、DRA 公開データが迅速に反映するように改修予定です。

左の Select type で対象データを絞り込むことができます。
対象データの種類とアクセッション番号プレフィックスは以下になります。

  • biosample: BioSample (SAMD/SAME/SAMN)
  • sra-run: SRA Run (DRR/ERR/SRR)
  • sra-experiment: SRA Experiment (DRX/ERX/SRX)
  • sra-sample: SRA Sample (DRS/ERS/SRS)
  • sra-submission: SRA Submission (DRA/ERA/SRA)
  • bioproject: BioProject (PRJD/PRJE/PRJN)
  • sra-study: SRA Study (DRP/ERP/SRP)
  • sra-analysis: SRA Analysis (DRZ/ERZ/SRZ)
  • jga-dataset: JGA Dataset
  • jga-study: JGA Study
  • jga-policy: JGA Policy
  • jga-dac: JGA DAC

DRASearch は11月19日に閉鎖いたしました。
DRASearch へのアクセッション番号リンクは対応する新検索システムのリンクにリダイレクトされます。

Submission accession:
https://ddbj.nig.ac.jp/DRASearch/submission?acc=DRA000001 –> https://ddbj.nig.ac.jp/resource/sra-submission/DRA000001

Experiment accession:
https://ddbj.nig.ac.jp/DRASearch/experiment?acc=DRX000001 –> https://ddbj.nig.ac.jp/resource/sra-experiment/DRX000001

Run accession:
https://ddbj.nig.ac.jp/DRASearch/run?acc=DRR000001 –> https://ddbj.nig.ac.jp/resource/sra-run/DRR000001

今後も新検索システムは改善を続けて参ります。