[復旧] 6/26更新 getentryでENAとGenBankから特定期間に公開されたエントリーを反映できていない

2025-6-26 時点の状況をお知らせいたします。

すべての公開が完了いたしました。INSDから公開された全flatfileに関しまして、getentryで検索いただけるようになりました。

getentryで公開されていなかったENA、GenBank由来エントリーの公開状況

• Conventional(non-bulk系)エントリー
  • ENA … 公開完了
  • GenBank … 公開完了
• Bulk系エントリー
  • TSA … 公開完了
  • TLS … 公開完了
  • WGS 4桁prefixのもの … 公開完了
  • WGS 6桁prefixのもの
    • ENA … 公開完了
    • GenBank … 公開完了
  • TPAのWGS … 公開完了

ENA、GenBankから以下の期間に公開されたエントリーがgetentryで公開できていませんでした。

対象は次の通りです。

• Conventional(non-bulk系)エントリー
  • ENA 2024年10月1日～2025年4月8日
  • GenBank 2025年2月19日～2025年4月8日
• Bulk系(WGS, TSA, TLS)エントリー
  • ENA/GenBank 2025年2/19～現在

未反映分を日々の公開処理に含めるようにしました。しかし、対象エントリー数が多いため、未反映分がgetentryから見えるようになるまで2か月程度かかる見込みでございます。その間、https://ddbj.nig.ac.jp/public/ddbj_database/ddbjnew/ に設置している DDBJNEW*.gz ファイルのサイズが普段より大きくなります。

ご迷惑をおかけし、誠に申し訳ございません。