2025-12-08 の状況をお知らせいたします。
現時点で、GenBank WGS 6桁prefixの2025年12月3日までのフラットファイルが公開できております。ダウンロード不具合で公開遅延していた分が解消できており、順次、最新フラットファイルの公開処理を行うことができております。ただし、日々の公開データ量に依存して数日の公開遅延が起こります点は、どうかご理解ください。
2025-12-03 時点の状況をお知らせいたします。
- WGS
- 6桁prefixのもの … 公開日が2025年11月26日まで公開完了
- 4桁prefixのもの … すべて公開済み
- TPA WGS
- 4桁および6桁prefixのもの … すべて公開済み
2025-12-02 時点の状況をお知らせいたします。
- WGS
- 6桁prefixのもの … 公開日が2025年11月25日まで公開完了
- 4桁prefixのもの … すべて公開済み
- TPA WGS
- 4桁および6桁prefixのもの … すべて公開済み
2025-12-01 時点の状況をお知らせいたします。
- WGS
- 6桁prefixのもの … 公開日が2025年11月22日まで公開完了
- 4桁prefixのもの … すべて公開済み
- TPA WGS
- 4桁および6桁prefixのもの … すべて公開済み
2025-11-25 時点の状況をお知らせいたします。
- WGS
- 6桁prefixのもの … 公開日が2025年10月19日まで公開完了
- 4桁prefixのもの … すべて公開済み
- TPA WGS
- 4桁および6桁prefixのもの … すべて公開済み
2025-11-21 時点の状況をお知らせいたします。
- WGS
- 6桁prefixのもの … 公開日が2025年9月25日まで公開完了
- 4桁prefixのもの … すべて公開済み
- TPA WGS
- 4桁および6桁prefixのもの … すべて公開済み
2025-11-19 時点の状況
- WGS
- 6桁prefixのもの … 公開日が2025年9月17日まで公開完了
- 4桁prefixのもの … すべて公開完了
- TPA WGS
- 6桁prefixのもの … 公開日が2025年11月9日まで公開完了
- 4桁prefixのもの … すべて公開完了
2025-11-17 時点の状況
全てのデータをダウンロードすることができました。未公開だったWGSエントリーが多いため、公開処理を順次行っております。
- WGS
- 6桁prefixのもの … 公開日が2025年9月14日まで公開完了
- 4桁prefixのもの … 公開日が2025年11月9日まで公開完了
- TPA WGS
- 6桁prefixのもの … 公開日が2025年10月8日まで公開完了
- 4桁prefixのもの … 公開日が2025年10月5日まで公開完了
11/11 GenBankから以下の期間に公開されたエントリーがgetentryとftpで公開できていません。
対象は次の通りです。
- 2025年9月3日以降にGenBankから公開された、WGSおよびTPA-WGSのすべて。
原因
- DDBJシステムが、GenBankからの WGSとTPA-WGSのダウンロードに失敗しているため。
ご迷惑をおかけし、誠に申し訳ございません。DDBJのダウンロードシステムを見直してデータを取得できるように改修中です。