バイオデータ研究拠点(BSI)では、データ登録を支援する以下のサービス・ツールを提供しています。登録先の選択から、ファイルの準備、登録前のチェックまでご活用いただけます。
登録ナビゲーション
データに関するいくつかの項目を選ぶだけで、どのデータベースに、どのように登録すればよいかをご案内します。初めて登録する方にもおすすめです。
データベース横断検索
クエリを AI で構築する支援機能を備えた、データベース横断検索システムです。登録するデータに似たデータを探す際にご利用ください。 https://bsi.nig.ac.jp/search
GGS (Genome/gene Submission Tool)
ゲノム配列の登録支援ツールです。ウェブ上で塩基配列に関する情報を入力すると、DDBJ の登録ファイル (アノテーションファイルと fasta ファイル) を生成します。Validator によるチェック結果も表示します。
Validator
https://github.com/ddbj/ddbj-validator
DDBJ・BioProject・BioSample・DRA・GEA・MetaboBank の全データベースのデータをチェックできるツールです。DDBJ では、アノテーション (ann)・配列 (fasta) ファイルをコマンドラインで事前にチェックできます。エラーやワーニングを解消してから MSS フォームで登録することで、登録完了までの時間を短縮できます。コマンドライン操作に不慣れな方は、GGS に DDBJ アカウントでログインし、ウェブページから ann・fasta ファイルをアップロードしてチェックすることもできます。チェック内容については、ルールリストをご覧ください。