D-STEP 講習会

第5回 D-STEP 講習会開催
質量分析インフォマティクス研究会(日本バイオインフォマティクス学会(JSBi))との共同開催で「第5回 D-STEP 講習会(第2回メタボロミクスソフトウェア講習会)」を開催いたします。
詳細は 第5回 D-STEP 講習会 をご覧ください。

D-STEP 講習会 について

生命データアナリスト養成プログラム「D-STEP 講習会」(DDBJ-Supercomputer Training & Educational Program)

本プログラムは、ROIS 機構長裁量プログラム(データサイエンス高度人材育成プログラム)への取り組みの一環として、ビッグデータの解析、主として次世代ゲノムシーケンス(NGS)解析需要に対応できる人材を国内で育成することを目的としています。また本プログラムで、DDBJはデータサイエンス共同利用基盤施設ゲノムデータ解析支援センターならびにライフサイエンス統合データベースセンターとの連携を強化します。 2017年度より2020年度までの間に、NGS データの様々な配列解析手法やゲノム以外のビッグデータ解析(機械学習、AIなど)について、DDBJ内外からの幅広い分野の講師によるハンズオンを主とした講習会を実施する予定です。

過去の資料は Google Drive からアクセスすることができます。

D-STEP 講習会 アーカイブ

第4回 D-STEP 講習会 with RinkaiHackathon2019

本講習会は,RinkaiHackathon2019 with DDBJing の一部として実施されました。島根大学との共同開催です。

  • 日時:2019年6月11日-12日
  • 場所:島根大学 生物資源科学部附属生物資源教育研究センター 隠岐臨海実験所(島根県)
  • 参加人数:15名
  • 講師:川島 武士(国立遺伝学研究所 生命ネットワーク研究室 助教)
       櫻井 望 ( 国立遺伝学研究所 DDBJセンター)
  • 講義:DDBJの利用方法
       メタボロームインフォマティクス 講習会
  • 協力:日本バイオインフォマティクス学会(JSBi)

詳細は RinkaiHackathon2019 をご覧ください。

第3回 D-STEP 講習会

  • 日時:2018年11月12日
  • 場所:理化学研究所横浜キャンパス(鶴見)交流棟ホール
  • 参加人数:100名

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タイトル 講師 資料
挨拶・趣旨の説明・簡単なメタボローム解析のイントロダクション 有田 正規 (国立遺伝学研究所理化学研究所)
GC-MS データの前処理から化合物同定・データのキュレーション方法 津川 裕司 (理化学研究所 環境資源科学研究センター)
LC-MS/MS を用いたノンターゲットリピドミクスとデータ解釈法 津川 裕司 (理化学研究所 環境資源科学研究センター)
LC-MS/MS を用いた親水性代謝物のプロファイリングとデータ解釈法 津川 裕司 (理化学研究所 環境資源科学研究センター)
未知マススペクトルからの構造推定方法と演習 津川 裕司 (理化学研究所 環境資源科学研究センター)
多変量解析の背景理論の説明(講義形式) 山本 博之 (ヒューマン・メタボローム・テクノロジーズ)
多変量解析演習(主成分分析・PLS-DA・PLS 回帰) 櫻井 望 (国立遺伝学研究所 DDBJ センター)

第2回 D-STEP 講習会

  • 日時:2018年7月14日
  • 場所:国立遺伝学研究所 (静岡県三島市)
  • 参加人数:20名
  • 言語:英語
タイトル 講師 資料
Introduction to NIG Supercomputer and DDBJ 有田 正規(国立遺伝学研究所 生命ネットワーク研究室 教授)
Genome assembly and polymorphism analysis of plants 平川 英樹(かずさ DNA 研究所 ゲノム情報解析施設 施設長)
Large-genome assembly using PacBio and Illumina reads 中村 保一 (国立遺伝学研究所 大量遺伝情報研究室 教授)

第1回 D-STEP 講習会 (第36回 DDBJing 講習会 in 三島)

  • 日時:2018年1月26日
  • 場所:国立遺伝学研究所 (静岡県三島市)
  • 参加人数:25名

資料は Google Drive からもご覧になれます。

タイトル 講師 資料
NGS解析を始めた時にぶつかりがちな小さい壁あれこれ 川島 武士(国立遺伝学研究所 生命ネットワーク研究室 助教)
ディープラーニングによる出芽酵母蛍光画像の細胞内タンパク質局在の分類 神沼 英里(国立遺伝学研究所 大量遺伝情報研究室 助教)