最終更新日:2014.6.25.

FAQ

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タグで検索(NSSS:DDBJ Nucleotide Sequence Submission System , MSS:Mass Submission System)

FAQs 6 : Tag = getentry
現在公開されている配列の更新前の内容を参照できますか getentry 更新 検索

getentry webAPI を使用して検索することが可能です。

検索方法は getentry ヘルプgethistory に関する説明をご参照ください。

最終更新日:2014年6月25日
最新データが最も早く参照できる検索サービスは何ですか getentry 検索

getentry です。
getentry はアクセッション番号等によりエントリを検索するシステムです。
通常、公開作業を行なった日の翌日にデータベース上に反映されます。

最終更新日:2014年6月25日
「DDBJ 定期リリース後」とは具体的にいつですか ARSA getentry リリース 検索
「DDBJ 新着データ(DDBJ 定期リリース後の新着データ)」は DDBJ 最新リリースの締め日の翌日以降に公開されたデータです。 最新リリースの締め日は リリースノート の文中に記述されています。 例えば,最新リリースが Release 67 の場合,以下のように2006年8月25日が締め日ですので, この時点の「DDBJ 新着データ」は8月26日以降公開されたデータになります。
The present release contains the newest data prepared by the DNA Data Bank ofJapan (DDBJ), GenBank (*), and European Molecular Biology Laboratory/EuropeanBioinformatics Institute (EMBL/EBI) as of August 25, 2006. (Rel.67 のリリースノートより抜粋,以下省略)
最終更新日:2015年6月8日
期待している検索結果が得られません,検索方法が誤っているのでしょうか ARSA BLAST getentry 検索
DDBJ/EMBL/GenBank は各データバンクに登録された配列を相互に交換しており, 総合的には基本的に同じデータを持っています。 ただし,各データバンクが公開したデータを互いに交換し合う際の時間差,更に各バンク内でそのデータを 検索サービスへ反映させる際の時間差により,同じ日の近い時間であっても検索サービスのデータには 微妙な差が存在している可能性があります。 期待している検索結果が得られないのは,これら時間差に負うところが大きいと思いますが, さらに詳細な調査が必要な場合はDDBJ へのお問い合わせ の「その他一般的な質問」から以下の情報をお知らせ下さい。
  • 検索プログラム名や検索を行なった URL
  • 検索条件
  • 検索を行った日時
  • 検索されるはずのエントリのアクセッション番号
  • 検索結果の URL
  • その他
また,Q and A の以下の質問もご参照下さい。
最終更新日:2015年6月15日
DDBJ に登録されたデータ(アクセッション番号)へ直接リンクを張る方法はありますか。 getentry 利用
最終更新日:2015年6月8日
TSA、WGSデータのFASTA形式のファイルを取得するにはどうしたらいいですか? getentry 検索

TSA、WGSデータのFASTA形式のファイルを取得するには、getentry で以下を指定し、検索を行ってください。

 ID:検索対象の Accession 番号を指定します。
 出力形式"全塩基配列 FASTA" を選択します。
 取得方法:以下から選択します。

  • html
  • テキスト
  • 圧縮ファイル(gz)
 上限:データの取得上限を設定します。
            0を指定すると上限なしの設定となります。

各項目の詳細は、getentry ヘルプ をご覧ください。

動画もあわせてご覧ください。

最終更新日:2016年7月19日
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