culture_collection に菌株 ID を所定書式で記載し、保存機関で記録されている元々の採取場所と日付を記載します。元々の採取場所や日付が分からない場合は、missing value の “not collected” を使用します。 研究室で長期間に渡って菌株を継代培養しており、その性質が変化している場合、シークエンス目的でサンプルを調整した日付を記載します。また、このケースにおいて、研究室の場所を記載することが適切ではない場合、exemption term の “missing: lab stock” を使用します。このようなケースでは description で「長期間に渡って分譲された菌株を継代培養しており、その性質が変化していること」を記載します。

例 国立研究開発法人 国立環境研究所 微生物系統保存施設 (NIES コレクション) の Arthrospira platensis NIES-39 株。チャド湖で採集されているが、採集年月は不明。

  • geo_loc_name (or /country) = Chad: Lake Chad
  • collection date = not collected