検索・解析

データベース検索

getentry 

アクセッション番号などによるエントリの検索
ARSA
高速なキーワード検索
TXSearch
生物分類データベース検索
BLAST
相同性検索
VecScreen
ベクター配列データベースを対象にした相同性検索サービス
DRA Search
DRA に登録されたデータを,キーワード,生物名,シークエンサなどで検索

系統解析

ClustalW
塩基配列・アミノ酸配列の多重整列と系統樹作成

WABI (Web API for Biology)

WABI は,DDBJの検索サービス を Web画面 を介せずに利用できるWeb API です。DDBJ では現在、次のサービスの Web API を提供しています。

WABI BLAST
getentry WebAPI

タンパク質データベース及び構造解析

PMD
変異タンパク質データベース

次世代 Sequence 解析

DDBJ Read Annotation Pipeline
次世代シークセンサ出力データの解析システム
(ご利用には申請が必要です)

ゲノム解析

MiGAP
微生物ゲノム配列のアノテーションツール
(ご利用には申請が必要です)
MiGAP-OLD (2012年2月以前の解析結果利用)
微生物ゲノム配列のアノテーションツール
(ご利用時のDBCLS のOpenID が必要です)
GTPS
共通プロトコルに基づくバクテリアゲノムの再アノテーション
GTOP
ゲノム配列からタンパク質の構造へ

DBCLS* の検索ツール

AOE
公共遺伝子発現データベースの目次
DBCLS SRA
公共次世代シーケンスデータの統計情報と検索機能を提供するサービス
Gendoo
遺伝子、疾患について、関連する疾患、薬剤、臓器、生命現象などの特徴をキーワードでリスト表示するツール
GGGenome
高速ゲノム配列検索ツール
GGRNA
高速な遺伝子検索エンジン
RefEx
ヒトおよびマウス、ラットにおける遺伝子発現データのリファレンスデータセット

*DBCLS : ライフサイエンス統合データベースセンター(Database Center for Life Science)

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