データベース検索

getentry 

アクセッション番号などによるエントリの検索
ARSA
高速なキーワード検索
TXSearch
生物分類データベース検索
BLAST
相同性検索
DDBJ Vector Screening System
ベクター配列データベースを対象にした相同性検索サービス
DRA Search
DRA に登録されたデータを,キーワード,生物名,シークエンサなどで検索

系統解析

ClustalW
塩基配列・アミノ酸配列の多重整列と系統樹作成

遺伝子発現データの登録

CIBEX    ※一時中断
遺伝子発現 DB・国際標準の MIAME 形式によるデータ登録と検索

ゲノム解析

GIB    ※一時中断
真正細菌・古細菌・真核生物ゲノムの統合検索
GIB-V    ※一時中断
ウィルスゲノムの統合検索
MiGAP
微生物ゲノム配列のアノテーションツール
(ご利用には申請が必要です)
MiGAP-OLD (2012年2月以前の解析結果利用)
微生物ゲノム配列のアノテーションツール
(ご利用時のDBCLS のOpenID が必要です)
GTPS
共通プロトコルに基づくバクテリアゲノムの再アノテーション
GTOP
ゲノム配列からタンパク質の構造へ

次世代 Sequence 解析

DDBJ Read Annotation Pipeline
次世代シークセンサ出力データの解析システム
(ご利用には申請が必要です)

タンパク質データベース及び構造解析

PMD
変異タンパク質データベース

CIB-DDBJ で開発したソフトウエア

WINA
同義置換数・非同義置換数のウィンドウ解析プログラム

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