メダカは日本人になじみが深く， 飼育のしやすさなどから日本では実験動物として良く利用されています。そのため，メダカ塩基配列データの多くは日本人研究者によって登録されています。
研究チームは7億塩基を解読し，20,141個の遺伝子を解明しました。８割以上がヒトの遺伝子と類似していることがわかり，そのため解読の成果は，今後脊椎動物進化の過程や，遺伝性疾患の原因の解明に役立つと期待されます。
この塩基配列は，Whole Genome Shotgun(WGS) ならびに Mass sequence for Genome Annotation(MGA) データとして DDBJ より DDBJ/EMBL/GenBank 国際塩基配列データベースに登録されており，アクセッション番号は，BAAF03000000(Hd-rR, version 0.9)，BAAF04000000(Hd-rR, version 1.0)，BAAE01000000(HNI)，ならびにACAAA0000001-ACAAA0356693(5'SAGE tags) です。
データは getentryで取得または，anonymousFTP一括取得（下記参照）することができます。
また，FTP を利用したリリースデータ取得のページの「WGS データ」と「MGA データ」よりダウンロードすることができますのでどうぞご利用下さい。
参考 URL： http://medaka.utgenome.org/
| アクセッション番号 | anonymousFTP 一括取得（ファイル名） | サイズ（圧縮） |
|---|---|---|
| BAAF03000000(Hd-rR, version 0.9) | Oryzias_latipes_WGS_060607_1.seq.gz | 334MB |
| BAAF04000000(Hd-rR, version 1.0) | Oryzias_latipes_WGS_070402_1.seq.gz | 302MB |
| BAAE01000000(HNI) | Oryzias_latipes_WGS_HNI_070402_1.seq.gz | 269MB |
| ACAAA0000001-ACAAA0356693 (5'SAGE tag) |
ACAAA_variable.gz | 3.9MB |