最終更新日:2014.9.26.

getentry ヘルプ

 

getentry の機能について

  • getentry では,アクセッション番号からの DDBJ フラットファイルの検索にご利用いただけます。
  • getentry は webAPI として実装しており,簡単な web フォームから利用するだけでなく,プログラムなどから直接呼び出すことが可能です。
  • データの変更履歴 検索機能 が,webAPI プログラムの gethistory として新規に追加されました。
  • 従来(2012.02 まで)の getentry にあった "DDBJ フラットファイルのキーワード検索" は ARSA で利用することが可能です。

入力フォームによる検索

http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/top-j.html からご利用下さい。

  

WebAPI プログラムと URL

getentry の web API は以下の2つのプログラムからなります。

getentry アクセッション番号(データベース中のエントリの ID)を与えると,データを返します。
gethistory
(この機能は新設)
アクセッション番号(データベース中のエントリの ID)を与えると,データの変更履歴を返します。

*特許庁由来アミノ酸配列の更新履歴は今のところとっておりません。
 

  

パラメータの指定方法

以下の2種類があります。

通常の GET method http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=データベース名&accession_number=アクセッション番号&追加のパラメーター(任意)
smart URL http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/データベース名/アクセッション番号

http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/データベース名/アクセッション番号/?追加のパラメーター(任意)

http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/データベース名/アクセッション番号/リビジョン ID /?追加のパラメーター(任意)

(例)
通常の GET method によるアクセッション番号 AB601234 の検索
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=ddbj&accession_number=AB601234
smart URL による特許庁由来アミノ酸配列 BD500001 の検索
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/patent_aa/BD500001

 

  

指定可能なパラメータについて

getentry

  • accession 番号(必須): 検索対象の Accession 番号を指定します。
  • database(任意): 検索対象のデータベースを指定します。
  • revision(任意): 指定された revision 時点を検索します。
  • format(任意): 結果の出力フォーマットを指定します。
  • filetype(任意): 出力のファイルタイプを指定します。
  • show_suppressed(任意): suppressed または replaced のデータを表示します。
  • limit(任意): データの取得上限を設定します。
  • trace(任意): Secondary Accession が指定された場合に,Primary への転送を設定します。


accession 番号(必須): 検索対象の Accession 番号を指定します。

バージョン番号
  • 指定がない場合は,最新バージョンを検索します。
  • 指定されている場合は,指定のバージョンを検索します
複数 Accession 番号
  • ","区切りで複数の Accession 番号を指定できます。
  • ","区切りで複数指定された場合,指定の順で出力されます。
  • 二つの Accession 番号"-"で連結することにより範囲検索ができます。
  • バージョン番号の指定もできます
範囲指定
  • 範囲指定の両端の Accession 番号は前方のみの不完全でも構いません。
  • 範囲指定も "," 区切りで複数指定できます。
  • バージョン番号を指定しても無視されます。
対象の Accession 番号が存在しない,または表示できない場合,該当の Accession 番号に対する結果は何も表示されず,limit で上限が制限されているときの数にもカウントされません。
デフォルトでの表示件数が10件に設定されているため,それ以上の件数を指定する場合には "limit" で設定を解除して下さい。
(入力例:上段はGET method , 下段は smart URL )
アクセッション番号AB055395 の検索
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=na&accession_number=AB055395
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/na/AB055395
特許庁由来アミノ酸配列の検索
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=patent_aa&accession_number=BD500001
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/patent_aa/BD500001
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=aa&accession_number=DI500001
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/aa/DI500001
複数アクセッション番号の検索(件数指定なし:10 件表示)
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=na&accession_number=AK388128,AK388131,AK388124,AK388126
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/na/AK388128,AK388131,AK388124,AK388126
複数アクセッション番号の検索(範囲指定&1000件表示)
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=na&accession_number=FY782000-FY783000&limit=1000
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/na/FY782000-FYFY783000?limit=1000
複数アクセッション番号の検索(複数指定&100件表示)
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=na&accession_number=AK377101 - AK377200,AK377210,AK377211- AK388100&limit=100
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/na/AK377101 - AK377200,AK377210,AK377211- AK388100?limit=100
複数アクセッション番号の検索(件数の上限なし)
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=na&accession_number=FY782538-FY831121&limit=0
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/na/FY782538-FY831121?limit=0
件数が多い場合,表示に時間がかかる場合があります。また,ブラウザの性能により,全件表示できない場合があります。
バージョン 番号指定の複数検索:指定したバージョンを検索します。
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=na&accession_number=AB669632.1,AB669632.2,AB669633.1,AB669633.2,AB669634.1
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/na/AB669632.1,AB669632.2,AB669633.1,AB66963.2,AB669634.1
バージョン番号指定の範囲指定検索:バージョン番号の指定は無視され,最新バージョンを検索します。
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=na&accession_number=AB669632.1-AB6696356.1
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/na/AB669632.1-AB6696356.1

 

database(任意): 検索対象のデータベースを指定します。

デフォルト na
DNA 系 na , mga
Protein 系 aa, uniprot, pdb, dad, patent_aa (特許庁由来アミノ酸配列)
na (デフォルト)を指定すると,DDBJ/EMBL/GenBank 三極のデータベースを検索します。
na を指定すると,WGS, TPA のエントリも検索対象となります。
※ DDBJ release に WGS,TPA は含まれておりません。
aa を指定すると,dad,patent_aa, uniprot, pdb をこの順番で検索します。
(入力例:上段はGet method , 下段は smart URL )
WGS( BAET01000001) の検索
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=na&accession_number=BAET01000001
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/na/BAET01000001
アクセッション番号 AB628096 の検索(database 指定なし)
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?accession_number=AB628096
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry//AB628096
MGA( AAAAA0000001) の検索
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/mga/AAAAA0000001
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/mga/AAAAA0000001
特許庁由来アミノ酸配列の検索
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=patent_aa&accession_number=DI500001
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/patent_aa/DI500001
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=aa&accession_number=BD500001
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/aa/BD500001
DAD の検索
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=dad&accession_number=AB000714-1
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/dad/AB000714-1
UniProt の検索
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=aa&accession_number=P06213
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/aa/P06213
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=uniprot&accession_number=P06213
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/uniprot/P06213

 


revision(任意): 指定された revision 時点を検索します。

通常 yyyy-MM-dd hh:mm:ss
リリース時 yyyy-MM-dd hh:mm:ss release
バージョン番号と revision が同時に指定されているとき,revision が優先されます。
(入力例:上段はGET method , 下段は smart URL )
AB479935 の 2011-05-31 23:07:30 時点での結果を表示
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=na&accession_number=AB479935&revision=2011-05-31 23:07:30
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/na/AB479935?revision=2011-05-31 23:07:30
変更履歴は gethistory の機能でしらべることが可能です
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/gethistory?database=na&accession_number=AB479935
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/gethistory/na/AB479935

 

format(任意): 結果の出力フォーマットを指定します。

デフォルト flatfile
flatfile DDBJ フラットファイル形式
xml INSDSeq-XML version 1.4 形式
fasta [DNA 系] 全塩基配列 FASTA
[Protein 系] アミノ酸配列 FASTA
trans [DNA 系] CDS アミノ酸 FASTA
cds [DNA 系] CDS 塩基配列 FASTA
[DAD 限定] 塩基配列 FASTA (for DAD)
seqres [Protein 系] PDB アミノ酸 FASTA
(入力例:上段はGET method , 下段は smart URL )
アクセッション番号 AB628096 の検索のflatfile を表示
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?accession_number=AB628096
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry//AB628096

LOCUS       AB628096                 390 bp    RNA     linear   VRL 24-FEB-2012
DEFINITION  Human rhinovirus C gene for polyprotein, partial cds, strain:
            HRV/Yamaguchi/2010/89.
ACCESSION   AB628096
VERSION     AB628096.1
KEYWORDS    .
SOURCE      Human rhinovirus C
  ORGANISM  Human rhinovirus C
            Viruses; ssRNA positive-strand viruses, no DNA stage;
            Picornavirales; Picornaviridae; Enterovirus.
REFERENCE   1  (bases 1 to 390)
  AUTHORS   Kobayashi,M., Arakawa,M., Okamoto,R., Tsukagoshi,H., Ryo,A.,
            Mizuta,K., Hasegawa,S., Hirano,R., Wakiguchi,H., Kudo,K.,
            Tanaka,R., Morita,Y., Noda,M., Kozawa,K., Ichiyama,T., Shirabe,K.
            and Kimura,H.
  TITLE     Direct Submission
  JOURNAL   Submitted (06-MAY-2011) to the DDBJ/EMBL/GenBank databases.
            Contact:Miho Kobayashi
            Gunma Prefectural Institute of Public Health and Environmental
            Sciences; Kamiokimachi 378, Maebashi, Gunma 371-0052, Japan
REFERENCE   2  
  AUTHORS   Arakawa,M., Okamoto-Nakagawa,R., Toda,S., Tsukagoshi,H.,
            Kobayashi,M., Ryo,A., Mizuta,K., Hasegawa,S., Hirano,R.,
            Wakiguchi,H., Kudo,K., Tanaka,R., Morita,Y., Noda,M., Kozawa,K.,
            Ichiyama,T., Shirabe,K. and Kimura,H.
  TITLE     Molecular epidemiological study of human rhinovirus species A, B
            and C from patients with acute respiratory illnesses in Japan
  JOURNAL   J. Med. Microbiol. 61, 410-419 (2012)
  REMARK    DOI:10.1099/jmm.0.035006-0
COMMENT     
FEATURES             Location/Qualifiers
     source          1..390
                     /collection_date="14-Jan-2010"
                     /country="Japan:Yamaguchi"
                     /db_xref="taxon:463676"
                     /host="Homo sapiens"
                     /isolation_source="Nasopharyngeal swab"
                     /mol_type="genomic RNA"
                     /organism="Human rhinovirus C"
                     /strain="HRV/Yamaguchi/2010/89"
     CDS             1..>390
                     /codon_start=1
                     /product="polyprotein"
                     /protein_id="BAK22546.1"
                     /transl_table=1
                     /translation="MGAQVSKQNVGSHENSVSATGGSVIKYFNINYYKDSASSGLTKQ
                     DFSQDPSKFTQPLAEALTNPALMSPTVEACGMSDRLKQITIGNSTITTQDTLNSILAY
                     GEWPKYLSDLDASSVDKPTHPETSSDRF"
BASE COUNT          124 a           95 c           77 g           94 t
ORIGIN      
        1 atgggcgcac aggtgagcaa gcaaaatgtc ggctcgcacg aaaattcagt ctcagccacg
       61 ggtggatccg tgattaagta tttcaacatc aattactaca aggattctgc tagctctggc
      121 ttgactaaac aagatttttc ccaagaccca tcgaaattca cacaacctct agcagaagca
      181 cttacaaatc cagctttaat gtcaccaact gttgaagcat gtgggatgtc cgataggctt
      241 aaacaaatta ctatcgggaa ttccactata acaacacaag atacactaaa ctctatactg
      301 gcatatgggg agtggcccaa atacttgagt gacctggacg cttcctcagt ggataagcct
      361 acccacccag agacatcatc tgatagattt
//
 
特許庁由来アミノ酸配列の検索結果を アミノ酸配列FASTA 形式 で表示
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=patent_aa&accession_number=BD500001&format=fasta
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/patent_aa/BD500001?format=fasta
>BD500001|JP 2000316586-A/3: Recombinant microorganism expressing small rubber particle-bound protein (SRPP).
MAEEVEEERLKYLDFVRAAGVYAVDSFSTLYLYAKDISGPLKPGVDTIENVVKTVVTPVY
YIPLEAVKFVDKTVDVSVTSLDGVVPPVIKQVSAQTYSVAQDAPRIVLDVASSVFNTGVQ
EGAKALYANLEPKAEQYAVITWRALNKLPLVPQVANVVVPTAVYFSEKYNDVVRGTTEQG
YRVSSYLPLLPTEKITKVFGDEAS
 
アクセッション番号 AB601234 を塩基配列 FASTA 形式で表示
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?accession_number=AB601234&format=fasta
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry//AB601234?format=fasta
>>AB601234|AB601234.1 Ainsliaea faurieana chs gene for chalcone synthase, partial cds, haplotype: 2.
ggaccttgctaaaaacaataagggctcacatgtccttgttgtctgctctgagatcattgc
ttccatttttcgtagaccagataagaaccacattgtcagccaagctctctttggggatgg
agcttctgcgctcattgtgggttcagacccagacttctccaaggaacatccattattcaa
gattgtgtctacaactcagacaatcttacagaacactgaaagggcgatgaacttacaatt
gagggaagaagggttgaccattcacctgcacagggatgtaccccagatgacatcaaagaa
tatagaggaggcattagtgcacatatttttgccactgggcataagagactggaactcg
 
アクセッション番号 AB601234 を塩基配列 xml 形式で表示
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=na&accession_number=AB601234&format=xml
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/na/AB601234/?format=xml
<?xml version="1.0"?>

<!DOCTYPE INSDSet SYSTEM "INSD_INSDSeq.dtd">
-<INSDSet>
 -<INSDSeq> <INSDSeq_locus>AB601234</INSDSeq_locus>
  <INSDSeq_length>358</INSDSeq_length>
   <INSDSeq_moltype>DNA</INSDSeq_moltype>
    <INSDSeq_topology>linear</INSDSeq_topology>
     <INSDSeq_division>PLN</INSDSeq_division>
      <INSDSeq_update-date>18-MAY-2011</INSDSeq_update-date>
       <INSDSeq_definition>Ainsliaea faurieana chs gene for chalcone ......
         <INSDSeq_primary-accession>AB601234</INSDSeq_primary-accession>
         <INSDSeq_accession-version>AB601234.1</INSDSeq_accession-version>
          <INSDSeq_source>Ainsliaea faurieana</INSDSeq_source>
           <INSDSeq_organism>Ainsliaea faurieana</INSDSeq_organism>
            <INSDSeq_taxonomy>Eukaryota; Viridiplantae; Streptophyta; .......
             -<INSDSeq_references>
              -<INSDReference>
              <INSDReference_reference>1</INSDReference_reference>
               <INSDReference_position>1..358</INSDReference_position>
                -<INSDReference_authors> <INSDAuthor>Mitsui,Y.</INSDAuthor>
                 <INSDAuthor>Setoguchi,H.</INSDAuthor> </INSDReference_authors>
                  <INSDReference_title>Direct Submission</INSDReference_title>
                   <INSDReference_journal>Submitted (17-NOV-2010) to the DDBJ/.....
                    -<INSDReference>

                                   -------   以下略    -----
アクセッション番号 HE963104 をCDS塩基配列fasta 形式で表示
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=na&accession_number= HE963104&format=cds
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/na/HE963104/?format=cds
 >HE963104-1|CCJ27876.1|111|<1..111|Streptococcus thermophilus|predicted.....
gggttgtcctgtgatgagggaatgctggcagtaggaggacttggtgctgtaggtggcccg
tggggagctgtcggtggggtgttagtaggtgcagccttatactgtttctaa

>HE963104-2|CCJ27877.1|201|130..330|Streptococcus thermophilus|hypothetical.....
atgaataataaacaacttgaaagatttaaaaaactggatacaaatgcattgtctaatgta
agtggtcaaggctatggtgctcaatgtgttattggtactgccggaatgacgattgtcggt
gcagctttctttggcatcgcaggtgcaggagctggatttgcaggcggtagcacagcattt
tgttatggtacagctgaataa

>HE963104-3|CCJ27878.1|219|686..>904|Streptococcus thermophilus|.....
atggcaactcaaacaattgaaaactttaacacccttaacctcgaaacacttgctagtgtt
gaaggaggtggatgtggttggagaggcgcaggtggagcgactgttcaaggagctatcggg
ggagcgtttggaggtaatgtagttttaccagttgtaggctcagttcctggttatctagct
ggtggtgttctaggtggtgcaggtggtactgttgcctat
 
PDBの検索結果を アミノ酸配列FASTA 形式 で表示
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=pdb&accession_number=0-Z&format=seqres&limit=5
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/pdb/0-Z/?format=seqres&filetype=html&limit=5
>100d_A mol:na length:10 DNA/RNA (5'-R(*CP*)-D(*CP*GP*GP*CP*GP*CP*CP*G
CCGGCGCCGG
>100d_B mol:na length:10 DNA/RNA (5'-R(*CP*)-D(*CP*GP*GP*CP*GP*CP*CP*G
CCGGCGCCGG
>101d_A mol:na length:12 DNA (5'-D(*CP*GP*CP*GP*AP*AP*TP*TP*(CBR)P*GP*
CGCGAATTCGCG
>101d_B mol:na length:12 DNA (5'-D(*CP*GP*CP*GP*AP*AP*TP*TP*(CBR)P*GP*
CGCGAATTCGCG
>101m_A mol:protein length:154 MYOGLOBIN
----(以下略)----

 


filetype(任意): 出力のファイルタイプを指定します。

デフォルト text
html HTMLファイル(ACCESSION, ORGANISM等 にリンクあり)
text テキストファイル
gz gz圧縮ファイル
gz圧縮ファイルのファイル名はformatの指定値によって以下のようになります。

[DNA系]flatfile
[DNA系]xml
[DNA系]fasta
[DNA系]trans
[DNA系]cds
[Protein系]flatfile
[Protein系]fasta
[Protein系]cds
flatfile.txt.gz
insd.xml.gz
fasta_na.txt.gz
cds_aa.txt.gz
cds_na.txt.gz
flatfile.txt.gz
fasta_aa.txt.gz
cds_aa.txt.gz
(入力例:上段はGet method , 下段は smart URL )
AK377185-AK378194(1000エントリ)を gzファイルでダウンロード
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=na&accession_number=AK377185-AK378194&filetype=gz&limit=1000
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/ddbj/AK377185-AK378194?filetype=gz&limit=1000

パソコン上に上記のような画面が表示されます。

アクセッション番号 FW383979を html 表示
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=na&accession_number=FW383979&filetype=html
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/na/AB601234/?filetype=html

LOCUS       FW383979                2675 bp    DNA     linear   PAT 14-OCT-2010
DEFINITION  JP 2006521812-A/1: GENETIC POLYMORPHISMS ASSOCIATED WITH RHEUMATOID
            ARTHRITIS, METHODS OF DETECTION AND USES THEREOF.
ACCESSION   FW383979
VERSION     FW383979.1
KEYWORDS    JP 2006521812-A/1.
SOURCE      Homo sapiens (human)
  ORGANISM  Homo sapiens
            Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi;
            Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini;
            Catarrhini; Hominidae; Homo.
REFERENCE   1  (bases 1 to 2675)
  AUTHORS   Alexander,H.C., Bigobikku,A.B. and Kagiru,M.
  TITLE     GENETIC POLYMORPHISMS ASSOCIATED WITH RHEUMATOID
            ARTHRITIS, METHODS 
            OF DETECTION AND USES THEREOF 
  JOURNAL   Patent: JP 2006521812-A 1 28-Sep-2006;
            APLERA CORPORATION
COMMENT     OS   Homo sapiens
            PN   JP 2006521812-A/1
            PD   28-Sep-2006
                               
 

 
 


show_suppressed (任意): suppressed データを表示します。

true suppressed データを表示
false suppressed データを表示しない
(入力例:上段はGet method , 下段は smart URL )
アクセッション番号 HE602933 (suppressed)の検索
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=na&accession_number=HE602933&show_suppressed=true
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/na/HE602933?show_suppressed=true

 
 


limit(任意): データの取得上限を設定します。

デフォルト 10件
0以下の数字を指定 無制限
(入力例:上段はGet method , 下段は smart URL )
アクセッション番号 FY736910 - FY762881( 25,972 entries)の検索
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=na&accession_number=FY736910 - FY762881&limit=0
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/na/FY736910 - FY762881?limit=0

件数が多い場合,表示に時間がかかる場合があります。また,ブラウザの性能により,全件表示できない場合があります。
 
 

trace(任意): Secondary Accession が指定された場合に,Primary への転送を設定します。

true primary データを表示
false primary データを表示しない
(入力例:上段はGet method , 下段は smart URL )
アクセッション番号 AB233943(primary)-AF530906(secondary) の検索でprimary を表示
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=na&accession_number=AF530906&format=flatfile&trace=true
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/na/AF530906/?format=flatfile&trace=true

 
 

  

gethistory

  • accession 番号(必須):検索対象のAccession番号を指定します。
  • database(任意): 検索対象のデータベースを指定します。
  • revision(任意): 指定されたrevision時点を検索します。
  • filetype(任意): 出力のファイルタイプを指定します。


accession 番号(必須):検索対象のAccession番号を指定します。

指定方法は getentry と同じです。

(入力例:上段はGet method , 下段は smart URL )
アクセッション番号 AB628096 の履歴検索
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/gethistory?database=na&accession_number=AB628096
http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/gethistory/na/AB628096
AB628096
1 2012-05-25 12:00:00 release 2012-05-25 12:00:00 release live
1 2012-02-24 07:02:55 2012-02-24 07:02:55 live
1 2011-11-25 11:27:22 release 2011-11-25 11:27:22 release live
1 2011-10-22 23:01:47 2011-10-22 23:01:47 live
1 2011-08-26 10:33:50 release 2011-08-26 10:33:50 release live
1 2011-05-27 12:38:45 release 2011-05-27 12:38:45 release live
1 2011-05-11 23:09:49 2011-05-11 23:09:49 live

特許庁由来アミノ酸配列の履歴はありません

 

 

database(任意):検索対象のデータベースを指定します。

デフォルト na
DNA 系 na

指定したデータベースが履歴管理に対応していない場合は,空の結果を返します。



filetype(任意): 出力のファイルタイプを指定します。

デフォルト text
html HTMLファイル
text テキストファイル

  

DDBJ エントリへのリンク設定方法

DDBJ の個々のエントリに対して,以下の方法でリンクを設定することができます。

  • http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=データベース名&accession_number=アクセッション番号&追加のパラメーター(任意)
  • http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/データベース名/アクセッション番号
  • http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/データベース名/アクセッション番号/?追加のパラメーター(任意)

 
例えば,アクセッション番号が AB000001 であるエントリに対する URL は

  • http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=na&accession_number=AB000001
  • http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/na/AB000001

 
アクセッション番号が BD500001 である特許庁由来アミノ酸配列のエントリに対する URL は,

  • http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry?database=aa&accession_number=BD500001
  • http://getentry.ddbj.nig.ac.jp/getentry/patent_aa/BD500001

 
これを指定すると,該当のエントリが表示されます。試しに次のアクセッション番号をクリックしてみて下さい。

 
DRA へのリンク設定方法は,上記の方法とは異なりますので,DRA のホームページをご参照下さい。

ご自身のホームページを作成される場合に,この URL をご活用下さい。

 
 

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