DDBJ 塩基配列登録システム (NSSS) では、FASTA 形式 (登録数が1配列の場合) または multi-FASTA 形式 (登録数が複数配列の場合) で塩基配列を入力してください。
関連ページ: 塩基配列のフォーマットについて

MSS から登録する場合には、終端子として配列情報終了フラグ (//) の挿入が必要です。 登録ファイル形式-配列ファイルを参照してください。

参考: ウィキペディア “FASTAフォーマット”