• getentryでENAとGenBankから特定期間に公開されたエントリーを反映できていない

Sequence Read Archive

  • Home
  • Submission
    • Metadata
    • Data Files
    • Update
    • Example
    • Analysis
  • FAQ
  • Search
  • Downloads
    • FASTQ
    • SRA
  • ホーム
  • dra
  • メタデータの例

メタデータの例

オブジェクトの構成例

実際のデータにあわせて柔軟にオブジェクトを構成します。

  • 最もシンプルなケース
  • 三つの菌株の比較ゲノム解析 (ペアエンド)
  • Biological replicate がある場合 (ペアエンド)
  • 別々の Submission を一つの BioProject でまとめる場合
  • Umbrella project で関連するプロジェクトをまとめる場合

最もシンプルなケース

最もシンプルなケース
最もシンプルなケース

三つの菌株の比較ゲノム解析 (ペアエンド)

ペアリードファイルは同じ Run に含めます。

三つの菌株の比較ゲノム解析 (ペアエンド)
三つの菌株の比較ゲノム解析 (ペアエンド)

Biological replicate がある場合 (ペアエンド)

Biological replicate がある場合 (ペアエンド)
Biological replicate がある場合 (ペアエンド)

別々の Submission を一つの BioProject でまとめる場合

別々の Submission を一つの BioProject でまとめる場合
別々の Submission を一つの BioProject でまとめる場合

Umbrella project で関連するプロジェクトをまとめる場合

Umbrella project で関連するプロジェクトをまとめる場合
Umbrella project で関連するプロジェクトをまとめる場合

メタデータの記入例

ウェブツールで Experiment/Run をタブ区切りテキストファイル (tsv) で登録する場合の記入例。
メタデータ tsv の記入例シート

メタデータエクセル

メタデータ登録用エクセルから XML を生成して Experiment/Run を登録する場合のエクセル記入例。
example-0001_dra_metadata.xlsx