MetaboBank
データファイル
- ファイル名は英数字 [A-Z,a-z,0-9]、アンダースコア [_]、ハイフン [-] とドット [.] のみから構成され、空白文字、カッコ、句読点やシンボルを含まないようにしてください。
- Study 単位でユニークなファイル名にしてください。
- Study やサンプル単位で tar や zip でアーカイブしたファイルでの登録は受付けています。
- サブディレクトリを含めることができます。
- 測定機器から出力される生データファイルにはユーザのローカルファイルパスが記録されていることがあります。パスに個人情報が含まれないようにしてください。
Mass spectrometry (MS)
生データファイル
測定機器から出力された生データファイル。
mzML 等のオープンスタンダード形式のデータは生データとして扱います。
SDRF の Raw Data File カラムに各サンプルに対応した生データファイル名を記載します。
サンプル (SDRF の一行) に対応する複数のファイルは tar や zip で一つのファイルにまとめます。
測定機器から出力される生データファイルにはユーザのローカルファイルパスが記録されていることがあります。パスに個人情報が含まれないようにしてください。
解析済みデータファイル
関連論文における主張の直接的な根拠となる解析済みデータやサマリーデータ。
SDRF の Processed Data File カラムに各サンプルに対応した解析済みデータファイル名を記載します。
サンプルに対応する複数のファイルは tar や zip で一つのファイルにまとめます。
Metabolite assignment file
同定・推定した化合物に関する情報は所定のファイル形式である Metabolite assignment file (MAF) として登録します。 MAF の各項目の説明はエクセルをご覧ください。
- MS 用 MAF エクセル (download)
画像ファイル
MS イメージング実験では画像ファイルも登録します。
SDRF の Image Data File カラムに各サンプルに対応した画像データファイル名を記載します。
サンプルに対応する複数のファイルは tar や zip で一つのファイルにまとめます。
できるだけイメージングの設定に関するファイルを含めてください。
NMR
生データファイル
測定機器から出力された生データファイル。
nmrML 等のオープンスタンダード形式のデータファイルは生データとして扱います。
SDRF の Raw Data File カラムに各サンプルに対応した生データファイル名を記載します。
サンプルに対応する複数のファイルは tar や zip で一つのファイルにまとめます。
できるだけ NMR の設定に関するファイルを含めてください。
解析済みデータファイル
関連論文における主張の直接的な根拠となる解析済みデータやサマリーデータ。
SDRF の Processed Data File カラムに各サンプルに対応した解析済みデータファイル名を記載します。
サンプルに対応する複数のファイルは tar や zip で一つのファイルにまとめます。
Metabolite assignment file
同定・推定した化合物に関する情報は所定のファイル形式である Metabolite assignment file (MAF) として登録します。 MAF の各項目の説明はエクセルをご覧ください。
- NMR 用 MAF エクセル (download)