TogoVar-repository

TogoVar-repository はヒトのバリアントと頻度情報のための公的データベースです。TogoVar-repository はバリアントを「50 bp 以下の短いバリアント」と「50 bp よりも大きい構造バリアント」の二つに分けて受付けています。

  • 短いバリアント: 50 bp 以下のバリアント。一塩基バリアントや短い挿入・欠失。データは NCBI dbSNP と交換されます。
  • 構造バリアント: 50 bp よりも大きい構造バリアント。挿入、欠失、重複、逆位、転座や複雑なバリアント。データは NCBI dbVar と交換されます。

TogoVar-repository と dbSNP/dbVar はヒトのバリアントのみ受付けています。EBI の European Variation Archive はヒトとヒト以外の生物からのバリアントを受付けています。