• getentryでENAとGenBankから特定期間に公開されたエントリーを反映できていない
  • 5月29日 DDBJ アカウント (9-10時) と JGA/AGD (9-14時) システム停止

TogoVar-repository

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Metadata

データモデル

TogoVar-repository SNP/SV で共通のデータモデルを使用しています。

TogoVar-repository データモデル
TogoVar-repository データモデル
  • BioProject と BioSample は必須。
  • バリアントは Dataset を介して Study/SampleSet にリンク。
  • SampleSet/Experiment/Dataset は連番で内部的に参照。

アクセッション番号

  • SNP: study (dstd), variant (dss). 公開された dss バリアントは次回の dbSNP build で rs にマージされます。
  • SV: study (dstd), variant call (dssv), variant region (dsv)

登録用エクセル

登録用エクセルをダウンロードして内容を記入します。 異なる種別のバリアント (SNP と SV) は別々の study として登録してください。

TogoVar-repository submission excel