Metadata

データモデル

TogoVar-repository SNP/SV で共通のデータモデルを使用しています。

• BioProject と BioSample は必須。
• バリアントは Dataset を介して Study/SampleSet にリンク。
• SampleSet/Experiment/Dataset は連番で内部的に参照。

アクセッション番号

• SNP: study (dstd), variant (dss). 公開された dss バリアントは次回の dbSNP build で rs にマージされます。
• SV: study (dstd), variant call (dssv), variant region (dsv)

登録用エクセル

登録用エクセルをダウンロードして内容を記入します。 異なる種別のバリアント (SNP と SV) は別々の study として登録してください。

TogoVar-repository submission excel