DDBJ センターについて

DDBJ (DNA Data Bank of Japan) センターは生命科学の研究活動をサポートするために、欧州のEBI、米国のNCBIと国際塩基配列データベース連携 INSDC (International Nucleotide Sequence Database Collaboration) を実施しています。あわせて、それを活用できるスーパーコンピュータシステムを提供しています。

活動理念

生命科学のめざましい発展には、塩基配列から得られる知識を欠かすことができません。今日の生命科学では、コンピュータが実験器具と同等に必要です。たいへんなスピードで蓄積される塩基配列データなどの生命情報を処理・解析するにはコンピュータ科学・情報技術が必須です。これが生命情報学を誕生させ、発展させている原動力となっています。DDBJセンターは、生命情報学のための環境と人材を整備しつつ、国内外における生命科学分野で主要な役割を果たすことを目的としています。

INSDC が提供する情報は、目的や国籍にかかわらず閲覧転用できる科学の共有財です。 世界中の研究者は DDBJ、ENA、GenBank の何れかを通じて INSDC にデータを登録できます。DDBJ センター事業の柱は、研究者の方々がデータを公開・共有する際に、なるべく同じ規則に従った表現で、できるだけ豊かな情報をストレスなく記入していただく仕組みづくりと、公共財の質の向上です。

塩基配列データは久遠の時間をかけて生物が進化してきたことを直接示す記録です。塩基配列データが人類共通の財産であるという認識のもとに、INSDCはデータを公開しています。

運営体制

DDBJ センターは、文部科学省からの予算により、静岡県三島市にある大学共同利用法人 情報・システム研究機構 国立遺伝学研究所 (NIG: National Institute of Genetics) で運営されています。

DDBJ 事業は所外委員会である DNA データ研究利用委員会に加え、EBI, NCBI, NIG が委嘱する国際諮問委員会によって監督されています。

現在の DDBJ 運営スタッフはこちらをご覧ください。

主要な活動

国際塩基配列データベースの共同構築と運営

DDBJセンターは、国際塩基配列データベース連携 INSDC の一員です。

DDBJ に登録された全ての塩基配列データには、DDBJ のアクセッション番号 (accession number)を発行しています。アクセッション番号は、塩基配列データベースに登録される塩基配列データに対して個別に与えられ、その配列データに固有のものです。DDBJ に登録されたデータは、公開時に NCBI と EBI に送られ、世界共通です。 日本からの登録の99%以上が、DDBJ を通じて行われています。

特許出願関連塩基配列データ、および、アミノ酸配列データの提供

国際塩基配列データベース連携 (INSDC) には、日本、韓国、欧州、および、米国の特許庁が収集・処理した塩基配列データも含まれています。
このうち、DDBJ センターは日本および韓国の特許庁による配列データを公開しています。

参照：

• 特許出願に含まれる配列データの利用に関する注意
• 特許・知的所有権と優先権
• DDBJ での特許関連配列データの公開業務の紹介

国立遺伝学研究所スーパーコンピュータシステム利用の管理・運用

国立遺伝学研究所スーパーコンピュータシステムは、ゲノム解析を主な目的としたクラスタ型計算機、大規模メモリ共有型計算機、および高速ディスク装置で構成された計算拠点です。

生命情報データの検索・解析サービス提供

生命情報データベースの提供

詳細は WWW サービスを御覧ください。FTP によるデータベースの一括取得もご利用ください。

データ解析用ソフトウェアツールの開発・提供

詳細は国立遺伝学研究所スーパーコンピュータシステムのページで御覧ください。

教育 および 広報

利用者の方々に塩基配列データの登録方法や提供サービスを、より深く理解し有効に活用していただくため、DDBJing 講習会を実施しています。

• DDBJ の最新情報
• DDBJ の活動

沿革