• DDBJ Search で新規公開・再公開された DRA が検索できません
  • DRA 検証処理における不具合
  • (5/3-5/6) ゴールデンウィーク中の対応について

WABI Web API for Biology(休止中)

  • ホーム
  • サービス
  • WABI Web API for Biology(休止中)

WABI (Web API for Biology)

WABI は、 DDBJの検索サービス を Web画面 を介せずに利用できる Web API です。
この Web API を利用することによって、 DDBJの検索サービス に対する検索処理登録や検索結果取得などを行なうプログラムを作成することができます。
具体例として BLAST の検索条件を確認する場合を示してみますと、次のような URI に対して GETメソッド で HTTPリクエスト することによって、下のようなレスポンスを受け取ることができます。

http://ddbj.nig.ac.jp/wabi/blast/wabi_blast_1111-1111-1111-11-111-111111?info=request&format=json
 1{
 2        "address": "",
 3        "database": "hum",
 4        "datasets": "ddbjall",
 5        "format": "text",
 6        "parameters": " -v 100 -b 100 -e 10 -F F -W 11 ",
 7        "program": "blastn",
 8        "querySequence": ">my query sequence\nCACCCTCTCT\nTCACTGGAAA\nGGACACCATG\nAGCACGGAAA\nGCATGATCCA\nGGACGTGGAA\n",
 9        "result": "www" 
10}

現在 WABI は、次のサービスの Web API を提供しています。

  • BLAST
  • getentry
  • ARSA
  • ClustalW
  • VecScreen
  • MAFFT

Related pages

  • WABI BLAST ヘルプ
  • WABI ClustalW ヘルプ
  • WABI VecScreen ヘルプ
  • WABI MAFFT ヘルプ
  • ARSA ヘルプ
  • BLAST ヘルプ
  • getentry ヘルプ
  • VecScreen ヘルプ
  • ClustalW ヘルプ
  • TXSearch ヘルプ
  • 過去のサービス
  • 関連論文
  • Pipeline ヘルプ