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登録概要

ヒトを対象とした研究データの登録について
研究対象者に由来するデータを DDBJ センターが運営するデータベースに登録する場合、研究対象者の尊厳及び人権は、適用されるべき法令、指針、ガイドライン、登録者が所属している機関の方針に従い、登録者の責任において保護されている必要があります。原則として、研究対象者を直接特定し得る情報はメタデータから取り除いてください。 ヒトを対象とした研究データを登録する場合は「ヒトを対象とした研究データの登録について」を熟読してください。

登録の流れ

  • 登録アカウントの取得
  • 新規登録の作成
  • シークエンスデータファイルのアップロード
  • BioProject の登録
  • BioSample の登録
  • Experiment/Run メタデータの登録
    • ウェブツールで登録
    • エクセルで登録
  • データファイルのチェック

登録ステータス

登録ステータスで進捗状況を把握することができます。”submission_validated” と “data_error” になった登録が DRA チームで査定されます。

ステータス 状態
new メタデータの登録前
metadata_submitted メタデータが登録された
data_validating データファイルの検証処理中
data_error データファイルの検証処理エラー
submission_validated メタデータとデータファイルの検証処理を通過
completed アクセッション番号が発行された
confidential 公開用ファイルの作成処理が完了し、非公開に保たれている
public 公開された
wait_for_release 公開まで30日以内
canceled キャンセル

アクセッション番号

登録完了後、メタデータオブジェクトにアクセッション番号が発行されます。

  • Experiment (プレフィックス DRX)
  • Run (プレフィックス DRR)
  • Analysis (プレフィックス DRZ)
  • Submission (プレフィックス DRA)

アクセッション番号の引用については「FAQ: 投稿論文ではどのアクセッション番号を引用するべきでしょうか?」をご覧ください。

データ公開

データは公開原則に従って公開されます。 参照関係にあるデータとの連動公開については、「FAQ: BioProject/BioSample/塩基配列データの連動公開の仕組みは?」を参照してください。
公開処理が実施されるとデータが夜間に ftp に公開され、数日以内に DDBJ Search でインデックスされ、NCBI SRA と EBI SRA にミラーリングされます。

オブジェクトは Submission 単位で公開されます。オブジェクトを異なる時期に公開したい場合は Submission を分けてください。

登録済みファイルの期間限定提供

登録者が登録済みデータを確認できるようにするため、登録が完了した Run の fastq/SRA ファイルは受付サーバ (ftp-private.ddbj.nig.ac.jp) の登録者領域にコピーされます。 ディスク容量圧迫を防ぐため、コピーされたファイルは一ヶ月後に削除されます。

  • (submitter’s home)/report/dra/(DRA submission accession)/fastq/
  • (submitter’s home)/report/dra/(DRA submission accession)/sra/

例 /report/dra/DRA000001/fastq/DRR000001.fastq.bz2

登録の更新

公開予定日延長、メタデータの更新やデータの追加・削除については DRA の更新をご覧ください。