登録概要

ヒトを対象とした研究データの登録について: 研究対象者に由来するデータを DDBJ センターが運営するデータベースに登録する場合、研究対象者の尊厳及び人権は、適用されるべき法令、指針、ガイドライン、登録者が所属している機関の方針に従い、登録者の責任において保護されている必要があります。原則として、研究対象者を直接特定し得る情報はメタデータから取り除いてください。ヒトを対象とした研究データを登録する場合は「ヒトを対象とした研究データの登録について」を熟読してください。

GEA はマイクロアレイや次世代シークエンサから出力される機能ゲノミクスデータを受け付けています。データの登録先については登録ナビゲーションを参照してください。

GEA が受付けているデータ	GEA が受付けていないデータ
定量的な遺伝子発現、遺伝子発現制御、エピジェネティクス解析や SNP genotyping 等の機能ゲノミクス研究から得られたデータ。例: mRNA プロファイリング、RNA-seq small RNA プロファイリング、miRNA-seq ChIP-Seq HiC-seq methyl-seq、bisulfite-seq SNP マイクロアレイ genotyping データが GEA に登録可能かどうか不明な場合はお問い合わせください。	アクセス制限が必要なヒトデータ (JGA に登録してください) アセンブルされた転写産物 (DRA と DDBJ TSA に登録してください) 全ゲノムシークエンス (DRA と DDBJ WGS に登録してください) メタゲノムシークエンス (DRA と DDBJ ENV に登録してください) リシークエンス、塩基配列変異やコピー数変異 (DRA とヒトデータは TogoVar-repository、ヒト以外のデータは EBI Variation Archive に登録してください) Survey シークエンスやエキソームシークエンス (DRA に登録してください) メタボロミクスデータ (MetaboBank に登録してください) プロテオミクスデータ (jPOST に登録してください)

GEA が受付けているデータ

GEA が受付けていないデータ

定量的な遺伝子発現、遺伝子発現制御、エピジェネティクス解析や SNP genotyping 等の機能ゲノミクス研究から得られたデータ。
例:

データが GEA に登録可能かどうか不明な場合はお問い合わせください。

アクセス制限が必要なヒトデータ (JGA に登録してください)
アセンブルされた転写産物 (DRA と DDBJ TSA に登録してください)
全ゲノムシークエンス (DRA と DDBJ WGS に登録してください)
メタゲノムシークエンス (DRA と DDBJ ENV に登録してください)
リシークエンス、塩基配列変異やコピー数変異 (DRA とヒトデータは TogoVar-repository、ヒト以外のデータは EBI Variation Archive に登録してください)
Survey シークエンスやエキソームシークエンス (DRA に登録してください)
メタボロミクスデータ (MetaboBank に登録してください)
プロテオミクスデータ (jPOST に登録してください)

登録ファイル

GEA の Experiment と Array design に対してアクセッション番号が発行されます (n は整数)。

関連する論文が公表されるまでデータを非公開にすることができます。四年後までの公開予定日を設定し、随時延長することができます。登録されたデータはデータ公開原則に従って公開されます。

データの登録後、査読者用のアクセストークンを発行することができます。詳しくは Reviewer accesss をご覧ください。

データを更新・削除はGEA 更新依頼から GEA チームに依頼してください。