Genome Project のデータ登録

ゲノム配列決定の各段階と登録データの種別の対応を示します。
実際には併用されることも多いのですが、下図では典型的な手法の各段階を模式的に示しています。
なお、大規模なゲノム配列決定プロジェクトは BioProject と BioSample にも ご登録ください。

重要:ヒトを対象とした研究データの登録について

下記もご参照ください。

• Finished level genomic sequences
• Pseudohaplotype
• INSDC standards for genome assembly submission
• メタゲノムアセンブリ、MAG
• Single amplified genome SAG

[DRA] Raw outputs 次世代シークエンサの出力

次世代シークエンサからの出力データは DDBJ Sequence Read Archive (DRA)へご登録ください。

[WGS] Contigs: assemblies (overlapping reads)

冗長な raw read sequences ではなく、ある程度計算機処理を経た overlapping reads の配列は、WGS として Mass Submission System から ご登録ください。

[HTG] draft sequences of large clones

finished レベルに達していない BAC, YAC, fosmid clone などの概要配列は HTG として Mass Submission System から ご登録ください。

Finished level genomic sequences

一般的なデータ、または、complete genome として Mass Submission System から ご登録ください。