DDBJ Annotated/Assembled Sequences
Transcriptome Project のデータ登録
Transcriptome Project のデータ登録
Transcriptome の各段階と登録データの種別の対応を示します。
下図では典型的な手法の各段階を模式的に示しています。
なお、次世代シークエンサをご使用の際は、BioProject と BioSample にも ご登録ください。
- [DRA] Raw outputs 次世代シークエンサの出力
- 次世代シークエンサからの出力データは DDBJ Sequence Read Archive (DRA)へご登録ください。
- [DTA] Chromatograms, Sequences, Qualities: Sanger 法の出力
- single-path read の DNA sequence chromatograms (traces), base calls, quality estimates は、DDBJ Trace Archive (DTA) へご登録ください。
- [TSA] Contigs: assemblies (overlapping reads) と Scaffolds
- アセンブルされた cDNA 配列データは、TSA として Mass Submission System から ご登録ください。
- [EST] Expressed Sequence Tags
- single-pass read の cDNA 配列は、EST として Mass Submission System から ご登録ください。
- [HTC] draft sequences of full length insert cDNA clones
- 完全長の cDNA (mRNA) を cloning する手法を用いて作製された cDNA library から得られた概要配列データは HTC として Mass Submission System から ご登録ください。
- Finished sequences of cDNA clones
- 一般的なデータ、または、full length insert cDNA として Mass Submission System から ご登録ください。