• セキュリティ強化の追加メンテナンスのため JGA/AGD サービスが停止
  • 国際塩基配列データベース「DDBJ」に対するサイバー脅迫に関するご報告

活動

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      • 第1回 DDBJing 講習会 in 三島

        • 1999/09/13
        • 講習会
        第1回 DDBJing 講習会 in 三島

      • 生命情報研究センター・DDBJ 合同講習会（1999.9.16 〜 2007.11.29-30）

        • 1999/09/16
        • 講習会
        生命情報研究センター・DDBJ 合同講習会（1999.9.16 〜 2007.11.29-30）

      • 第2回 DDBJing 講習会 in 札幌

        • 1999/11/10
        • 講習会
        第2回 DDBJing 講習会 in 札幌

      • 第3回 DDBJing 講習会 in 三島

        • 2000/08/23
        • 講習会
        第3回 DDBJing 講習会 in 三島

      • 第4回 DDBJing 講習会 in 福岡

        • 2000/11/30
        • 講習会
        第4回 DDBJing 講習会 in 福岡

      • 第5回 DDBJing 講習会 in 東京

        • 2001/09/03
        • 講習会
        第5回 DDBJing 講習会 in 東京

      • 第6回 DDBJing 講習会 in 三島

        • 2002/01/30
        • 講習会
        第6回 DDBJing 講習会 in 三島

      • 日韓中バイオインフォマティクストレーニングコース（第１回〜第８回）

        • 2002/03/15
        • 講習会
        日韓中バイオインフォマティクストレーニングコース（第１回〜第８回）

      • 第7回 DDBJing 講習会 in 高知

        • 2003/08/29
        • 講習会
        第7回 DDBJing 講習会 in 高知

      • 第8回 DDBJing 講習会 in 遺伝学会

        • 2003/09/24
        • 講習会
        第8回 DDBJing 講習会 in 遺伝学会

      • 第9回 DDBJing 講習会 ＆ 第6回 情報生物学『寺子屋』 in 東京

        • 2004/03/28
        • 講習会
        第9回 DDBJing 講習会 ＆ 第6回 情報生物学『寺子屋』 in 東京

      • 第10回 DDBJing 講習会 in 三島

        • 2004/07/07
        • 講習会
        第10回 DDBJing 講習会 in 三島

      • 第11回 DDBJing 講習会 & PDBjing 講習会 in 大阪

        • 2005/03/02
        • 講習会
        第11回 DDBJing 講習会 & PDBjing 講習会 in 大阪

      • 第12回 DDBJing 講習会 in 三島

        • 2005/06/08
        • 講習会
        第12回 DDBJing 講習会 in 三島

      • 第13回 DDBJing 講習会 in 東京農大

        • 2005/09/01
        • 講習会
        第13回 DDBJing 講習会 in 東京農大

      • 第14回 DDBJing 講習会 ＆ PDBjing 講習会 in 大阪

        • 2006/02/02
        • 講習会
        第14回 DDBJing 講習会 ＆ PDBjing 講習会 in 大阪

      • 第15回 DDBJing 講習会 in 三島

        • 2006/06/14
        • 講習会
        第15回 DDBJing 講習会 in 三島

      • 第16回 DDBJing 講習会 & PDBjing 講習会 in 東京

        • 2006/12/21
        • 講習会
        第16回 DDBJing 講習会 & PDBjing 講習会 in 東京

      • 第17回 DDBJing 講習会 in 三島

        • 2007/05/29
        • 講習会
        第17回 DDBJing 講習会 in 三島

      • 第18回 DDBJing 講習会 ＆ 寺子屋『情報生物学』 in 香川

        • 2007/11/29
        • 講習会
        第18回 DDBJing 講習会 ＆ 寺子屋『情報生物学』 in 香川

      • 第19回 DDBJing 講習会 in 三島

        • 2008/06/18
        • 講習会
        第19回 DDBJing 講習会 in 三島

      • 第20回 DDBJing 講習会 ＆ KEGGing 講習会 ＆ PDBjing 講習会 in 京都

        • 2008/11/27
        • 講習会
        第20回 DDBJing 講習会 ＆ KEGGing 講習会 ＆ PDBjing 講習会 in 京都

      • 第21回 DDBJing 講習会 in 三島

        • 2009/06/17
        • 講習会
        第21回 DDBJing 講習会 in 三島

      • 第22回 DDBJing 講習会 & AJACS in 東京

        • 2010/06/23
        • 講習会
        第22回 DDBJing 講習会 & AJACS in 東京

      • 第23回 DDBJing 講習会 ＆ PDBj 講習会 in 長浜

        • 2011/01/17
        • 講習会
        第23回 DDBJing 講習会 ＆ PDBj 講習会 in 長浜

      • 第24回 DDBJing 講習会 in 東京

        • 2011/06/30
        • 講習会
        第24回 DDBJing 講習会 in 東京

      • 第25回 DDBJing 講習会 in 三島

        • 2012/01/26
        • 講習会
        第25回 DDBJing 講習会 in 三島

      • 第26回 DDBJing 講習会 in 三島

        • 2013/01/24
        • 講習会
        第26回 DDBJing 講習会 in 三島

      • 第27回 DDBJing 講習会 in 三島

        • 2013/07/04
        • 講習会
        第27回 DDBJing 講習会 in 三島

      • 第28回 DDBJing 講習会 in 新潟

        • 2013/11/19
        • 講習会
        第28回 DDBJing 講習会 in 新潟

      • 第29回 DDBJing 講習会 in 三島

        • 2014/06/12
        • 講習会
        第29回 DDBJing 講習会 in 三島

      • 第30回 DDBJing 講習会 in 東京

        • 2014/12/18
        • 講習会
        第30回 DDBJing 講習会 in 東京

      • 第31回 DDBJing 講習会 in 東京

        • 2015/06/12
        • 講習会
        第31回 DDBJing 講習会 in 東京

      • 初めての All-in-one 合同講習会〜生命科学DB・ツールの使い方～

        • 2019/07/18
        • 講習会
        初めての All-in-one 合同講習会〜生命科学DB・ツールの使い方～

      • 第32回 DDBJing 講習会 in 那覇植物防疫事務所（on-demand）

        • 2015/07/29
        • 講習会
        第32回 DDBJing 講習会 in 那覇植物防疫事務所（on-demand）

      • 第33回 DDBJing 講習会 in 東京

        • 2015/11/11
        • 講習会
        第33回 DDBJing 講習会 in 東京

      • DDBJ データ解析チャレンジ

        • 2016/06/27
        • 講習会
        DDBJ データ解析チャレンジでは、DDBJ 保有のビッグデータである塩基配列公開データベースを用いて、チャレンジ課題の機械学習モデルの精度を競います。 構築モデルは京都大学のビッグデータ大学に...

      • DDBJデータ解析チャレンジ 2016 キックオフ講習会

        • 2016/07/06
        • 講習会
        日時：2016年7月6日

      • All-in-one 合同講習会 2016 ～バイオビッグデータ解析入門～

        • 2016/07/23
        • 講習会
        All-in-one 合同講習会 2016 ～バイオビッグデータ解析入門～

      • 第34回 DDBJing 講習会 in 三島

        • 2016/12/15
        • 講習会
        第34回 DDBJing 講習会 in 三島

      • All-in-one 合同講習会 2017 ～生命科学の最先端に触れてみよう～

        • 2017/05/27
        • 講習会
        All-in-one 合同講習会 2017 ～生命科学の最先端に触れてみよう～

      • 第35回 DDBJing 講習会 in 沖縄工業高等専門学校（on-demand）

        • 2017/10/19
        • 講習会
        第35回 DDBJing 講習会 in 沖縄工業高等専門学校（on-demand）

      • 第1回 D-STEP 講習会 & 第36回 DDBJing 講習会 in 三島

        • 2018/01/26
        • 講習会
        第1回 D-STEP 講習会 & 第36回 DDBJing 講習会 in 三島

      • 第37回 DDBJing 講習会 with RinkaiHackathon2018

        • 2018/06/11
        • 講習会
        第37回 DDBJing 講習会 with RinkaiHackathon2018

      • Symposium on Evolutionary Genetics and Omics

        • 2018/07/13
        • 講習会
        国立遺伝学研究所では2018年7月13日（金）, 14日（土）に「Symposium on Evolutionary Genetics and Omics」を開催いたします。 このシンポジウムで...

      • 第2回 D-STEP 講習会

        • 2018/07/14
        • 講習会
        第2回 D-STEP 講習会

      • 第3回 D-STEP 講習会

        • 2018/11/12
        • 講習会
        第3回 D-STEP 講習会

      • All-in-one 合同講習会 2018／統合データベース講習会：AJACS 番町２

        • 2019/01/28
        • 講習会
        All-in-one 合同講習会 2018／統合データベース講習会：AJACS 番町２

      • 第4回 D-STEP 講習会 with RinkaiHackathon2019

        • 2019/06/11
        • 講習会
        第4回 D-STEP 講習会 with RinkaiHackathon2019

      • 第38回 DDBJing 講習会 with MS-BIO.info

        • 2019/06/22
        • 講習会
        第38回 DDBJing 講習会 with MS-BIO.info

      • 第39回 DDBJing 講習会 with 「先進ゲノム支援」情報解析講習会

        • 2019/10/09
        • 講習会
        第39回 DDBJing 講習会 with 「先進ゲノム支援」情報解析講習会

      • 第5回 D-STEP 講習会（第２回メタボロミクスソフトウェア講習会）

        • 2019/11/11
        • 講習会
        第5回 D-STEP 講習会（第２回メタボロミクスソフトウェア講習会）

      • 第40回 DDBJing 講習会 with IIBMP2020

        • 2020/09/02
        • 講習会
        第40回 DDBJing 講習会 with IIBMP2020

      • 第6回 D-STEP 講習会 with Japan-Indonesia Workshop

        • 2020/10/20
        • 講習会
        第6回 D-STEP 講習会 with Japan-Indonesia Workshop

      • 第６回 D-STEP講習会 with 植物インフォマティクス研究会

        • 2021/01/27
        • 講習会
        第６回　D-STEP講習会 with 植物インフォマティクス研究会

      • 第41回 DDBJing 講習会 in 北海道大学（on-demand）

        • 2021/04/21
        • 講習会
        第41回 DDBJing 講習会 in 北海道大学（on-demand）

      • 第7回 D-STEP 講習会 with Japan-Vietnam Workshop

        • 2021/08/24
        • 講習会
        第7回 D-STEP 講習会 with Japan-Vietnam Workshop

      • 第42回 DDBJing 講習会 with IIBMP2021

        • 2021/09/27
        • 講習会
        第42回 DDBJing 講習会 with IIBMP2021

      • 第8回 D-STEP講習会 with 植物インフォマティクス研究会

        • 2021/10/05
        • 講習会
        第8回 D-STEP講習会 with 植物インフォマティクス研究会

      • 第8回 D-STEP 講習会 with Japan-Thailand Workshop

        • 2023/01/19
        • 講習会
        第8回 D-STEP 講習会 with Japan-Thailand Workshop

      • 第9回 D-STEP 講習会 with Japan-Malaysia Workshop

        • 2024/02/19
        • 講習会
        第9回 D-STEP 講習会 with Japan-Malaysia Workshop

      • DDBJ update in 2023: the MetaboBank for metabolomics data and associated metadata.

        • 2024 / 1 / 6
        • 論文

        Ara T, Kodama Y, Tokimatsu T, Fukuda A, Kosuge T, Mashima J, Tanizawa Y, Tanjo T, Ogasawara O, Fujisawa T, Nakamura Y, Arita M.

        Nucleic Acids Res 2024 Jan 5;52(D1):D67-D71 Pubmed: 37971299

      • DDBJ サービスの統合化を目指して

        • 2022 / 10 / 5
        • 講演発表

        藤澤 貴智、小笠原 理、中村 保一、有田 正規

        トーゴーの日シンポジウム

      • MAGE-TAB のメタボロミクスデータへの展開と MetaboBank での利用

        • 2022 / 8 / 9
        • 講演発表

        児玉悠一

        日本プロテオーム学会2022年大会

      • MetaboBank：メタボローム研究のための一次レポジトリおよび統合データベース

        • 2022 / 6 / 24
        • 講演発表

        時松敏明、児玉悠一、福田亜沙美、藤澤貴智、長崎英樹、荒武、高橋みき子、大澤祥子、小林紀郎、櫻井望、福島敦史、金谷重彦、平川英樹、有田正規

        第70回質量分析総合討論会

      • 実験医学増刊 Vol.40 No.17 バイオDBとウェブツール ラボで使える最新70選?知る・学ぶ・使う、バイオDX時代の羅針盤

        • 2022 / 10 / 24
        • 出版物

        分担執筆: 児玉 悠一

        羊土社

      • Sapporo: A workflow execution service that encourages the reuse of workflows in various languages in bioinformatics

        • 2022 / 8 / 4
        • 論文

        Suetake H, Tanjo T, Ishii M, Kinoshita B, Fujino T, Hachiya T, Kodama Y, Fujisawa T, Ogasawara O, Shimizu A, Arita M, Fukusato T, Igarashi T, Ohta T.

        F1000Research 11:889 Pubmed:

      • The NBDC-DDBJ imputation server facilitates the use of controlled access reference panel datasets in Japan

        • 2022 / 12 / 20
        • 論文

        Hachiya T, Ishii M, Kawai Y, Khor SS, Kawashima M, Toyo-Oka L, Mitsuhashi N, Fukuda A, Kodama Y, Fujisawa T, Tokunaga K, Takagi T.

        Hum Genome Var 2022 Dec 20;9(1):48 Pubmed: 36539398

      • The Thing Metabolome Repository family (XMRs): comparable untargeted metabolome databases for analyzing sample-specific unknown metabolites

        • 2023 / 1 / 6
        • 論文

        Sakurai N, Yamazaki S, Suda K, Hosoki A, Akimoto N, Takahashi H, Shibata D, Aoki Y.

        Nucleic Acids Res 2023 Jan 6;51(D1):D660-D677 Pubmed: 36417935

      • DNA Data Bank of Japan (DDBJ) update report 2022

        • 2023 / 1 / 6
        • 論文

        Tanizawa Y, Fujisawa T, Kodama Y, Kosuge T, Mashima J, Tanjo T, Nakamura Y.

        Nucleic Acids Res 2023 Jan 6;51(D1):D101-D105 Pubmed: 36420889

      • DNA Data Bank of Japan (DDBJ) update report 2021

        • 2022 / 1 / 7
        • 論文

        Okido T, Kodama Y, Mashima J, Kosuge T, Fujisawa T, Ogasawara O.

        Nucleic Acids Res 2022 Jan 7;50(D1):D102-D105 Pubmed: 34751405

      • ゲノム医療におけるデータベース-使い方とコツ (遺伝子医学39号)

        • 2022 / 1 / 1
        • 出版物

        分担執筆: 秦 千比呂

        メディカルドゥ

      • メタゲノムデータ解析 16Sも!ショットガンも!ロングリードも! 菌叢解析が得意になる凄技レシピ (実験医学別冊)

        • 2021 / 11 / 30
        • 出版物

        分担執筆: 大城戸 利久、福田 亜沙美

        羊土社

      • TogoVar によるバリアント頻度情報統合と NBDC ヒトデータベースによるデータ共有推進

        • 2021 / 10 / 14
        • 講演発表

        豊岡 理人、三橋 信孝、川嶋 実苗、片山 俊明、川島 秀一、秦 千比呂、福田 亜沙美、児玉 悠一、藤澤 貴智、高木 利久

        日本人類遺伝学会第66回大会・第28回日本遺伝子診療学会大会

      • DDBJ サービス

        • 2021 / 10 / 5
        • 講演発表

        川添将仁、青野英雄、Andrea Ghelfi、李慶範、飯塚朋代、大城戸利久、児玉悠一、小菅武英、杉田里江、鈴木紀美子、高木佳苗、時松敏明、秦千比呂、福田亜沙美、真島淳、横山会美、藤澤貴智

        トーゴーの日シンポジウム

      • 生命情報・DDBJ センターのデータベースと生命科学ビッグデータ

        • 2021 / 4 / 15
        • 出版物

        秦 千比呂、児玉　悠一

        情報処理学会

      • 登録データから見る今後への期待と登録のポイント

        • 2021 / 3 / 20
        • 講演発表

        秦 千比呂

        日本蚕糸学会 第91回大会

      • バリアントデータ検索&活用 変異・多型情報を使いこなす達人レシピ (実験医学別冊)

        • 2020 / 9 / 25
        • 出版物

        分担執筆: 福田 亜沙美、秦 千比呂、児玉 悠一

        羊土社

      • GA4GH DURI Work Stream in GEM Japan 2020; localizing the Data Use Ontology and Machine-Readable Consent in the local research community.

        • 2020 / 9 / 29
        • 講演発表

        Chisato Yamasaki, Satoshi Nagaie, Minae Kawashima, Chihiro Hata, Shuichi Kawashima, Yuichi Kodama, Mizuki Morita, Natsuko Yamamoto, Akio Nagano, Keiko Katsui, Takako Takai, Soichi Ogishima

        GA4GH 8th Plenary Meeting

      • DDBJ サービス

        • 2020 / 10 / 5
        • 講演発表

        時松敏明, 青野英雄, 李慶範, 飯塚朋代, 大城戸利久, 川添将仁, 児玉悠一, 小菅武英, 杉田里江, 鈴木紀美子, 高木佳苗, 秦千比呂, 福田亜沙美, 真島淳, 横山会美, 藤澤貴智

        トーゴーの日シンポジウム

      • DDBJ update: streamlining submission and access of human data.

        • 2021 / 1 / 8
        • 論文

        Fukuda A, Kodama Y, Mashima J, Fujisawa T, Ogasawara O

        Nucleic Acids Res 2021 Jan 8;49(D1):D71-D75 Pubmed: 33156332

      • The international nucleotide sequence database collaboration.

        • 2021 / 1 / 8
        • 論文

        Arita M, Karsch-Mizrachi I, Cochrane G

        Nucleic Acids Res 2021 Jan 8;49(D1):D121-D124. Pubmed: 33166387

      • BioHackathon 2015: Semantics of data for life sciences and reproducible research.

        • 2020 / 2 / 24
        • 論文

        Vos RA, Katayama T, Mishima H, Kawano S, Kawashima S, Kim JD, Moriya Y, Tokimatsu T, Yamaguchi A, Yamamoto Y et al

        F1000Res 2020 Feb 24;9:136. Pubmed: 32308977

      • DDBJ Data Analysis Challenge: a machine learning competition to predict Arabidopsis chromatin feature annotations from DNA sequences.

        • 2020 / 3 / 26
        • 論文

        Kaminuma E, Baba Y, Mochizuki M, Matsumoto H, Ozaki H, Okayama T, Kato T, Oki S, Fujisawa T, Nakamura Y et al

        Genes Genet Syst 2020 Mar 26;():. Pubmed: 32213716

      • DDBJ Database updates and computational infrastructure enhancement.

        • 2020 / 1 / 8
        • 論文

        Ogasawara O, Kodama Y, Mashima J, Kosuge T, Fujisawa T

        Nucleic Acids Res 2020 Jan 8;48(D1):D45-D50. Pubmed: 31724722

      • Generating Publication-Ready Prokaryotic Genome Annotations with DFAST.

        • 2019
        • 論文

        Tanizawa Y, Fujisawa T, Arita M, Nakamura Y

        Methods Mol Biol 2019;1962():215-226. Pubmed: 31020563

      • TogoGenome/TogoStanza: modularized Semantic Web genome database.

        • 2019 / 1 / 1
        • 論文

        Katayama T, Kawashima S, Okamoto S, Moriya Y, Chiba H, Naito Y, Fujisawa T, Mori H, Takagi T

        Database (Oxford) 2019 Jan 1;2019():. Pubmed: 30624651

      • DDBJ update: the Genomic Expression Archive (GEA) for functional genomics data.

        • 2019 / 1 / 8
        • 論文

        Kodama Y, Mashima J, Kosuge T, Ogasawara O

        Nucleic Acids Res 2019 Jan 8;47(D1):D69-D73. Pubmed: 30357349

      • ChIP-Atlas: a data-mining suite powered by full integration of public ChIP-seq data.

        • 2018 / 12
        • 論文

        Oki S, Ohta T, Shioi G, Hatanaka H, Ogasawara O, Okuda Y, Kawaji H, Nakaki R, Sese J, Meno C

        EMBO Rep 2018 Dec;19(12):. Pubmed: 30413482

      • MACON: a web tool for computing DNA methylation data obtained by the Illumina Infinium Human DNA methylation BeadArray.

        • 2018 / 3
        • 論文

        Iida N, Okuda Y, Ogasawara O, Yamashita S, Takeshima H, Ushijima T

        Epigenomics 2018 Mar;10(3):249-258. Pubmed: 29343101

      • Minimum Information about an Uncultivated Virus Genome (MIUViG).

        • 2019 / 1
        • 論文

        Roux S, Adriaenssens EM, Dutilh BE, Koonin EV, Kropinski AM, Krupovic M, Kuhn JH, Lavigne R, Brister JR, Varsani A et al

        Nat Biotechnol 2019 Jan;37(1):29-37. Pubmed: 30556814

      • DNA Data Bank of Japan: 30th anniversary.

        • 2018 / 1 / 4
        • 論文

        Mashima J, Kodama Y, Fujisawa T, Katayama T, Okuda Y, Kaminuma E, Ogasawara O, Okubo K, Nakamura Y, Takagi T

        Nucleic Acids Res 2018 Jan 4;46(D1):D30-D35. Pubmed: 29040613

      • 次世代シーケンサーデータの解析手法 第10回 DDBJ への塩基配列の登録（実践編)

        • 2017 / 7
        • 論文

        谷澤 靖洋、藤澤 貴智、真島 淳、李 慶範、遠野 雅徳、坂本 光央、大熊 盛也、中村 保一、清水 謙多郎、門田 幸二

        日本乳酸菌学会誌 28(2) 94-100 2017年7月 Pubmed:

      • 次世代シーケンサーデータの解析手法 第9回 ゲノムアノテーションとその可視化、DDBJ への登録

        • 2017 / 3
        • 論文

        谷澤 靖洋、真島 淳、藤澤 貴智、李 慶範、中村 保一、清水 謙多郎、門田 幸二

        日本乳酸菌学会誌 28(1) 3-11 2017年3月 Pubmed:

      • DNA Data Bank of Japan.

        • 2017 / 1 / 4
        • 論文

        Mashima J, Kodama Y, Fujisawa T, Katayama T, Okuda Y, Kaminuma E, Ogasawara O, Okubo K, Nakamura Y, Takagi T

        Nucleic Acids Res 2017 Jan 4;45(D1):D25-D31. Pubmed: 27924010

      • DNA data bank of Japan (DDBJ) progress report.

        • 2016 / 1 / 4
        • 論文

        Mashima J, Kodama Y, Kosuge T, Fujisawa T, Katayama T, Nagasaki H, Okuda Y, Kaminuma E, Ogasawara O, Okubo K et al

        Nucleic Acids Res 2016 Jan 4;44(D1):D51-7. Pubmed: 26578571

      • The International Nucleotide Sequence Database Collaboration.

        • 2016 / 1 / 4
        • 論文

        Cochrane G, Karsch-Mizrachi I, Takagi T

        Nucleic Acids Res 2016 Jan 4;44(D1):D48-50. Pubmed: 26657633

      • The DDBJ Japanese Genotype-phenotype Archive for genetic and phenotypic human data.

        • 2015 / 1
        • 論文

        Kodama Y, Mashima J, Kosuge T, Katayama T, Fujisawa T, Kaminuma E, Ogasawara O, Okubo K, Takagi T, Nakamura Y

        Nucleic Acids Res 2015 Jan;43(Database issue):D18-22. Pubmed: 25477381

      • Toward richer metadata for microbial sequences: replacing strain-level NCBI taxonomy taxids with BioProject, BioSample and Assembly records.

        • 2014 / 1 / 15
        • 論文

        Federhen S, Clark K, Barrett T, Parkinson H, Ostell J, Kodama Y, Mashima J, Nakamura Y, Cochrane G, Karsch-Mizrachi I

        Stand Genomic Sci 2014 Jun 15;9(3):1275-7. Pubmed: 25197497

      • DDBJ progress report: a new submission system for leading to a correct annotation.

        • 2014 / 1
        • 論文

        Kosuge T, Mashima J, Kodama Y, Fujisawa T, Kaminuma E, Ogasawara O, Okubo K, Takagi T, Nakamura Y

        Nucleic Acids Res 2014 Jan;42(Database issue):D44-9. Pubmed: 24194602

      • DDBJ read annotation pipeline: a cloud computing-based pipeline for high-throughput analysis of next-generation sequencing data.

        • 2013 / 8
        • 論文

        Nagasaki H, Mochizuki T, Kodama Y, Saruhashi S, Morizaki S, Sugawara H, Ohyanagi H, Kurata N, Okubo K, Takagi T et al

        DNA Res 2013 Aug;20(4):383-90. Pubmed: 23657089

      • DDBJ new system and service refactoring.

        • 2013 / 1
        • 論文

        Ogasawara O, Mashima J, Kodama Y, Kaminuma E, Nakamura Y, Okubo K, Takagi T

        Nucleic Acids Res 2013 Jan;41(Database issue):D25-9. Pubmed: 23180790

      • The International Nucleotide Sequence Database Collaboration.

        • 2013 / 1
        • 論文

        Nakamura Y, Cochrane G, Karsch-Mizrachi I

        Nucleic Acids Res 2013 Jan;41(Database issue):D21-4. Pubmed: 23180798

      • The DNA Data Bank of Japan launches a new resource, the DDBJ Omics Archive of functional genomics experiments.

        • 2012 / 1
        • 論文

        Kodama Y, Mashima J, Kaminuma E, Gojobori T, Ogasawara O, Takagi T, Okubo K, Nakamura Y

        Nucleic Acids Res 2012 Jan;40(Database issue):D38-42. Pubmed: 22110025

      • The International Nucleotide Sequence Database Collaboration.

        • 2012 / 1
        • 論文

        Karsch-Mizrachi I, Nakamura Y, Cochrane G

        Nucleic Acids Res 2012 Jan;40(Database issue):D33-7. Pubmed: 22080546

      • The Sequence Read Archive: explosive growth of sequencing data.

        • 2012 / 1
        • 論文

        Kodama Y, Shumway M, Leinonen R

        Nucleic Acids Res 2012 Jan;40(Database issue):D54-6. Pubmed: 22009675

      • The sequence read archive.

        • 2011 / 1
        • 論文

        Leinonen R, Sugawara H, Shumway M

        Nucleic Acids Res 2011 Jan;39(Database issue):D19-21. Pubmed: 21062823

      • DDBJ progress report.

        • 2011 / 1
        • 論文

        Kaminuma E, Kosuge T, Kodama Y, Aono H, Mashima J, Gojobori T, Sugawara H, Ogasawara O, Takagi T, Okubo K, Nakamura Y.

        Nucleic Acids Res 2011 Jan;39(Database issue):D22-7. Pubmed: 21062814

      • The International Nucleotide Sequence Database Collaboration.

        • 2011 / 1
        • 論文

        Cochrane G, Karsch-Mizrachi I, Nakamura Y

        Nucleic Acids Res 2011 Jan;39(Database issue):D15-8. Pubmed: 21106499

      • Biological databases at DNA Data Bank of Japan in the era of next-generation sequencing technologies.

        • 2010
        • 論文

        Kodama Y, Kaminuma E, Saruhashi S, Ikeo K, Sugawara H, Tateno Y, Nakamura Y

        Adv Exp Med Biol 2010;680():125-35. Pubmed: 20865494

      • Archiving next generation sequencing data.

        • 2010 / 1
        • 論文

        Shumway M, Cochrane G, Sugawara H

        Nucleic Acids Res 2010 Jan;38(Database issue):D870-1. Pubmed: 19965774

      • DDBJ launches a new archive database with analytical tools for next-generation sequence data.

        • 2010 / 1
        • 論文

        Kaminuma E, Mashima J, Kodama Y, Gojobori T, Ogasawara O, Okubo K, Takagi T, Nakamura Y

        Nucleic Acids Res 2010 Jan;38(Database issue):D33-8. Pubmed: 19850725

      • Web API for biology with a workflow navigation system.

        • 2009 / 1
        • 論文

        Kwon Y, Shigemoto Y, Kuwana Y, Sugawara H

        Nucleic Acids Res 2009 Jul;37(Web Server issue):W11-6. Pubmed: 19417067

      • DDBJ dealing with mass data produced by the second generation sequencer.

        • 2009 / 1
        • 論文

        Sugawara H, Ikeo K, Fukuchi S, Gojobori T, Tateno Y

        Nucleic Acids Res 2009 Jan;37(Database issue):D16-8. Pubmed: 18927114

      • ゲノム科学＋DDBJ入門

        • 2019 / 11 / 20
        • 講演発表

        中村　保一

        静岡大学大学院・統合オミックス特論II

      • BioSample とは

        • 2019 / 11 / 13
        • 講演発表

        福田　亜沙美

        2019年度 ROIS-DS-JOINT共同研究集会 Annotathon2019 （生命科学データベースの利用価値向上のためのアノテーションマラソン）

      • Database and supercomputer resources for human data at DDBJ

        • 2019 / 10 / 16
        • 講演発表

        児玉 悠一、福田 亜沙美、八谷 剛史、秦 千比呂、真島 淳、藤澤 貴智、川嶋 実苗、豊岡 理人、三橋 信孝、小笠原 理

        The Annual Meeting of the American Society of Human Genetics 2019

      • DDBJサービス

        • 2019 / 10 / 5
        • 講演発表

        李 慶範

        トーゴーの日シンポジウム2019　～バイオデータベース：つないで使う～

      • How to deal with controlled-access data in DNA Data Bank of Japan

        • 2019 / 9 / 20
        • 講演発表

        Yasukazu Nakamura

        CODATA： the next-generation data-driven science

      • We are ready to 10 k microbe genomes

        • 2019 / 9 / 18
        • 講演発表

        Yasukazu Nakamura

        A high-level CODATA data policy meeting

      • 植物ゲノムの進化研究とDDBJと遺伝研スーパーコンピュータ活用法

        • 2019 / 8 / 4
        • 講演発表

        中村　保一

        木村資生進化学セミナー

      • DDBJ and the INSDC are faced with Big Data

        • 2019 / 9 / 1
        • 講演発表

        中村　保一

        国際生物学連合（IUBS）2019

      • DDBJ ? 日本DNAデータバンクとNGS ? Next Generation Sequencing によるゲノム解析の最新状況

        • 2019 / 7 / 4
        • 講演発表

        中村　保一

        山梨大学 学術研究会

      • ynlab & DDBJ’s activities

        • 2019 / 6 / 4
        • 講演発表

        中村　保一

        GOBii Workshop

      • DDBJ： Asian gateway to the INSDC

        • 2019 / 4 / 24
        • 講演発表

        中村　保一

        NAGP Bioinformtion center workshop 2019

      • DDBJ (DNA Data Bank of Japan) activity

        • 2019 / 4 / 9
        • 講演発表

        大城戸利久, 児玉悠一, 小菅武英, 真島 淳

        Biocuration2019

      • INSDC の一員としての DDBJ 事業の紹介と塩基配列決定の国際動向・INSDC への塩基配列データの登録と管理の実際

        • 2019 / 2 / 22
        • 講演発表

        中村　保一

        製品評価技術基盤機構NITEバイオテクノロジーセンターセミナー

      • 日本DNAデータバンクこれまでの30年とこれから

        • 2019 / 2 / 8
        • 講演発表

        中村　保一

        情報・システム研究機構シンポジウム2018 SDGsに向けた新しい取り組み

      • ゲノム時代の生命情報・DDBJセンターが果たしてきた役割

        • 2019 / 1 / 29
        • 講演発表

        青野 英雄

        All-in-one 合同講習会 2018／統合データベース講習会：AJACS 番町２

      • DDBJ センターにおけるデータベースサービスのこれまでとこれから

        • 2018 / 11 / 29
        • 講演発表

        児玉　悠一

        第41回日本分子生物学会年会 ワークショップ： いかにして公共データベースを生命科学研究に活用するか? (オーガナイザー)

      • Introduction of the INSDC, data submission & genome annotation

        • 2018 / 11 / 26
        • 講演発表

        中村　保一

        8th World Data Center for Microorganisms (WDCM) / Global Catalogue of Microorganisms GCM 2.0 10K type strain microbe sequencing project meeting

      • DDBJ / the INSDC is ready for GCM 2.0

        • 2018 / 11 / 21
        • 講演発表

        中村　保一

        8th WDCM / GCM 2.0 meeting

      • Resources for archiving, sharing and analysis of controlled-access human data at DDBJ Center.

        • 2018 / 10 / 18
        • 講演発表

        児玉　悠一

        The Annual Meeting of the American Society of Human Genetics 2018

      • DDBJ -登録データの拡充-

        • 2018 / 10 / 5
        • 講演発表

        大城戸利久, 小菅武英, 児玉悠一, 真島 淳

        トーゴーの日シンポジウム2018　～バイオデータベース：つないで使う～

      • DDBJ： Asian gateway to the INSDC

        • 2018 / 9 / 16
        • 講演発表

        中村　保一

        Agricultural Bioscience International Conference 2018

      • 大量塩基配列情報処理によるゲノム解析とデータベース構築

        • 2018 / 9 / 10
        • 講演発表

        中村　保一

        第一回植物インフォ研究会

      • ゲノム解析手法のトレンドとDDBJ・遺伝研スーパーコンピュータ

        • 2018 / 9 / 3
        • 講演発表

        中村　保一

        第二回木村資生記念進化学セミナー

      • Genome analyses using NGS for next-generation model species

        • 2018 / 8 / 30
        • 講演発表

        中村　保一

        The 16th KJC Bioinformatics Symposium

      • 次世代シークエンスデータベースの紹介と歩き方

        • 2018 / 8 / 29
        • 講演発表

        児玉　悠一

        統合データベース講習会:AJACS番町１

      • 塩基配列データの爆発的増加とDDBJをとりまく現状

        • 2018 / 8 / 4
        • 講演発表

        中村　保一

        遺伝研研究会・生命情報データの拡大と分子進化研究の進展

      • DDBJ/INSDC, NIG supercomputer & Large-genome assembly and annotation tools

        • 2018 / 7 / 14
        • 講演発表

        中村　保一

        DDBJ D-step training course 2018

      • DDBJ/INSDC/DFAST

        • 2018 / 6 / 26
        • 講演発表

        中村　保一

        GCM 2.0 workshop

      • 次世代シークエンスデータベースの紹介と使い方

        • 2018 / 1 / 17
        • 講演発表

        児玉　悠一

        統合データベース講習会：AJACS浜松

      • MarpolDB _ marchantia.info; a genome DB for the Liverwort

        • 2017 / 12 / 16
        • 講演発表

        中村 保一

        Renaissance of Marchantia polymorpha

      • MicrobeDB.jp

        • 2017 / 12 / 6
        • 講演発表

        中村 保一

        日本分子生物学会年会 NBDC ConBioフォーラム「生命科学のデータベース活用法」

      • DDBJ Sequence Read Archive（DRA）と Japanese Genotype-phenotype Archive（JGA）の紹介

        • 2017 / 12 / 5
        • 講演発表

        福田 亜沙美

        シーケンサー利用技術講習会 第14回　CAGEデータ解析およびFANTOM5データベース利用実技講習会

      • DDBJ にゲノムデータが来るとき

        • 2017 / 11 / 16
        • 講演発表

        真島 淳

        Annotathon 2017

      • DDBJ and the INSDC

        • 2017 / 10 / 26
        • 講演発表

        中村 保一

        ICG-12

      • Controlled-access databases for genetic and phenotypic human data in Japan.

        • 2017 / 10 / 19
        • 講演発表

        児玉 悠一, 福田 亜沙美, 真島 淳, 箕輪 真理, 川嶋 実苗, 宮崎 和典, 三橋 信孝, 神沼 英里, 小笠原 理, 大久保 公策, 中村 保一, 高木 利久

        The Annual Meeting of the American Society of Human Genetics 2017

      • DDBJ and the INSDC

        • 2017 / 10 / 10
        • 講演発表

        中村 保一

        The Big Data Forum for Life and Health Sciences

      • DDBJ

        • 2017 / 10 / 5
        • 講演発表

        中村 保一

        トーゴーの日シンポジウム

      • ゲノム科学・ゲノムDBの現場から

        • 2017 / 9 / 14
        • 講演発表

        中村 保一

        静岡大学大学院・統合オミックス特論II

      • DDBJ

        • 2017 / 7 / 19
        • 講演発表

        中村 保一

        GGBN Asian regional workshop

      • NBRPゲノム情報等整備プログラムの状況“CyanoBase

        • 2017 / 7 / 4
        • 講演発表

        中村 保一

        NBRP藻類・運営会議

      • How to make bio-DB’s and services sustainable?

        • 2017 / 6 / 20
        • 講演発表

        中村 保一

        日中韓バイオインフォマティクスシンポジウム

      • 拡大する公共データベースの役割

        • 2017 / 1 / 24
        • 講演発表

        児玉 悠一

        静岡県立大学 食品栄養科学部 学部講義

      • DDBJデータ解析チャレンジ報告：機械学習コンペティションのタスク設計とルール設定

        • 2016 / 12 / 1
        • 講演発表

        神沼英里, 馬場雪乃, 望月正弘, 松本拡高, 尾崎遼, 岡山利次, 加藤卓也, 沖真弥, 小笠原理, 鹿島久嗣, 高木利久

        第39回日本分子生物学会年会

      • DDBJ センターにおける一次データベースの展開

        • 2016 / 12 / 1
        • 講演発表

        児玉 悠一

        第39回日本分子生物学会年会　フォーラム： いかにして使えるデータベースを維持し続けるか?

      • JGA： Japanese Genotype-phenotype Archive

        • 2016 / 10 / 20
        • 講演発表

        児玉 悠一, 真島 淳, 箕輪 真理, 川嶋 実苗, 宮崎 和典, 三橋 信孝, 神沼 英里, 小笠原 理, 大久保 公策, 中村 保一, 高木 利久

        The Annual Meeting of the American Society of Human Genetics 2016

      • 生命科学とオープンデータ

        • 2016 / 2 / 8
        • 講演発表

        高木 利久

        オープンサイエンスにおける研究データのオープン化?大学のデータ駆動型学術研究を加速するために?

      • Database Resources of DNA Data Bank of Japan

        • 2016 / 1 / 10
        • 講演発表

        児玉 悠一, 真島 淳, 神沼 英里, 小笠原 理, 大久保 公策, 中村 保一, 高木 利久

        The Plant and Animal Genome XXIV Conference (PAG)

      • 次世代シークエンスデータの登録

        • 2015 / 12 / 16
        • 講演発表

        児玉 悠一

        第13回シーケンサー利用技術講習会 第13回CAGEデータ解析実技講習会

      • DDBJ

        • 2015 / 10 / 5
        • 講演発表

        中村 保一

        トーゴーの日シンポジウム2015

      • NGS の配列解析とデータベースへの案内

        • 2015 / 7 / 27
        • 講演発表

        中村 保一

        東京農業大学生物資源ゲノム解析センター 2015年度セミナー（文部科学省「私立大学戦略的研究基盤形成支援事業」）

      • NIG Supercomputer

        • 2015 / 7 / 18
        • 講演発表

        小笠原 理

        初めての All-in-one 合同講習会 ～生命科学DB・ツールの使い方～

      • DDBJ へのデータ登録

        • 2015 / 7 / 18
        • 講演発表

        真島 淳

        初めての All-in-one 合同講習会 ～生命科学DB・ツールの使い方～

      • DDBJ のデータベースと検索・解析

        • 2015 / 7 / 18
        • 講演発表

        中村 保一

        初めての All-in-one 合同講習会 ～生命科学DB・ツールの使い方～

      • DDBJ PipelineのQ&A対応まとめと解析ツール利用傾向

        • 2015 / 7 / 1
        • 講演発表

        神沼 英里

        NGS現場の会 第4回研究会

      • DDBJ と NIG Super Computer による大量配列情報解析

        • 2015 / 6 / 5
        • 講演発表

        中村 保一

        がんとハイポキシア研究会「データベースとハイポキシア研究」（遺伝研共同研究研究会）

      • DDBJと新型シーケンサ解析パイプラインの使い方

        • 2015 / 3 / 5
        • 講演発表

        中村 保一

        統合データベース講習会：AJACS府中

      • DDBJと新型シーケンサ解析パイプラインの使い方

        • 2015 / 2 / 28
        • 講演発表

        中村 保一

        新学術ゲノム支援・情報解析講習会

      • 塩基配列データベースを中心とした生物学系研究の情報基盤について

        • 2015 / 2 / 3
        • 講演発表

        小笠原 理

        平成26年度第2回学術情報基盤オープンフォーラム

      • INSDC・DDBJ の MIxS に関するとりくみと活用

        • 2014 / 12 / 7
        • 講演発表

        中村 保一

        第46回 種生物学シンポジウム

      • Enhancement of DDBJ nucleotide sequence submission system

        • 2014 / 11 / 26
        • 講演発表

        小菅 武英, 藤澤 貴智, 真島 淳, 筒井 波留, 江嶋 真由美, 神沼 英里, 高木 利久, 中村 保一

        第37回日本分子生物学会年会

      • DDBJ

        • 2014 / 10 / 5
        • 講演発表

        中村 保一

        トーゴーの日シンポジウム2014

      • 遺伝研スパコンとコマンドラインでのNGSデータ使い倒し講座

        • 2014 / 9 / 26
        • 講演発表

        神沼 英里

        日本育種学会第126回講演会

      • ビッグデータ時代のゲノム情報解析とクラウドソーシング

        • 2014 / 8 / 29
        • 講演発表

        神沼 英里

        日本学術会議学術フォーラム「生命情報ビッグデータ時代における新しい生命科学」

      • 国立遺伝学研究所スーパーコンピューターの概要と利用法

        • 2014 / 8 / 22
        • 講演発表

        中村 保一, 望月 孝子

        第32回 日本植物細胞分子生物学会年会　バイオインフォマティクス講習会II （2014）

      • JGA へのデータ登録

        • 2014 / 8 / 20
        • 講演発表

        児玉 悠一

        2014年度ゲノム支援拡大班会議

      • DDBJ配列解析サービス (DDBJ Pipeline)

        • 2014 / 7 / 22
        • 講演発表

        神沼 英里

        遺伝研スーパーコンピュータユーザー会

      • NGS 解析ツール： DDBJ Read Annotation Pipeline

        • 2014 / 3 / 22
        • 講演発表

        神沼 英里

        第125回日本育種学会講演会「NGS 使い倒し講座 - Breeding Informatics 研究 XII」

      • 次世代シーケンサによる研究のこれからとそれを支えるインフラ／技術／制度

        • 2013 / 12 / 5
        • 講演発表

        児玉 悠一, 仲里 猛

        第36回日本分子生物学会年会

      • 拡大する公共データベースの役割

        • 2013 / 11 / 27
        • 講演発表

        児玉 悠一

        東京大学大学院農学生命科学研究科 アグリバイオインフォマティクスセミナー

      • DDBJ スパコン概要

        • 2013 / 11 / 19
        • 講演発表

        中村 保一

        ゲノム支援 平成25年度情報解析講習会

      • 新世代シークエンスデータの登録

        • 2013 / 10 / 25
        • 講演発表

        児玉 悠一

        シーケンサー利用技術講習会 -第10回 サンプルQC、RNAseqライブラリー作製/データ解析実習講習会

      • DDBJ

        • 2013 / 10 / 4
        • 講演発表

        中村 保一

        トーゴーの日シンポジウム2013

      • DDBJ Pipelineと植物・微生物denovoアセンブリの知見紹介

        • 2013 / 9 / 4
        • 講演発表

        谷澤靖洋, 望月孝子, 長崎英樹, 藤澤貴智, 神沼英里, 遠野雅徳, 清水徳朗, 中村保一

        NGS現場の会 第３回研究会

      • ソーシャルゲノムアノテーション

        • 2013 / 9 / 2
        • 講演発表

        中村 保一

        明治大学・科学技術研究所シンポジウム「大規模オミックス情報解析がもたらす生命科学の新たな展開」

      • DDBJと新型シーケンサ解析パイプラインの使い方

        • 2013 / 8 / 30
        • 講演発表

        中村 保一

        統合データベース講習会：AJACS富山

      • データベースの統合はなぜ必要か？

        • 2013 / 8 / 30
        • 講演発表

        高木 利久

        統合データベース講習会：AJACS富山

      • 配列データのDDBJ/DRA/JGA登録方法

        • 2013 / 8 / 29
        • 講演発表

        中村 保一

        新学術ゲノム支援拡大全体会議

      • Introduction of DNA Data Bank of Japan activities.

        • 2013 / 6 / 17
        • 講演発表

        中村 保一

        第11回 日韓中バイオインフォマティクストレーニングコース

      • 国内の主要なDBの使い方（DDBJ, PDBj, KEGG）

        • 2013 / 1 / 13
        • 講演発表

        中村 保一

        統合データベース講習会：AJACS駿河

      • DDBJパイプラインによるゼニゴケゲノム解析とゲノムアノテーションデータベースの構築

        • 2012 / 12 / 11
        • 講演発表

        長崎 英樹, 藤澤 貴智, 望月 孝子, 猿橋 智, 神沼 英里, 石崎 公庸, 大和 勝幸, 河内 孝之, 中村 保一

        第35回日本分子生物学会年会

      • ますます多様化・大規模化する生命情報に求められる情報技術とは？

        • 2012 / 11 / 9
        • 講演発表

        高木 利久

        情報・システム研究機構シンポジウム2012 「生命科学のビッグデータ革命 - 仮想から現実へ -」

      • たくさんのゲノム情報をみんなで共有するために

        • 2012 / 11 / 3
        • 講演発表

        中村 保一

        国立遺伝学研究所 公開講演会2012「知りたい！生命科学の最先端」＋大学院説明会 2012

      • 生物研究の基盤 データベースとしての DDBJ事業： 継承と変革

        • 2012 / 10 / 27
        • 講演発表

        中村 保一

        第49回 日本癌治療学会学術集会

      • 日本DNAデータバンク (DDBJ)

        • 2012 / 10 / 5
        • 講演発表

        中村 保一

        トーゴーの日シンポジウム2012

      • 新型シークエンサのアーカイブ配列と解析パイプライン：系統間SNP解析を事例として

        • 2012 / 9 / 14
        • 講演発表

        神沼 英里, 望月 孝子, 長崎 英樹, 児玉 悠一, 猿橋 智, 大久保 公策, 高木 利久, 大柳 一, 倉田 のり, 清水 徳朗, 中村 保一

        第122回日本育種会講演会ワークショップ

      • 国際塩基配列データベース共同体(INSDC) -拡張するprimary databaseの活動-

        • 2012 / 8 / 9
        • 講演発表

        大城戸 利久

        バイオインフォマティクス講習会2012

      • DNA Data Bank of Japan： trad and new databases

        • 2012 / 7 / 24
        • 講演発表

        中村 保一

        Information Sources in Biotechnology： Key Databases for Patenting Biotechnology. A seminar organized by The European Bioinformatics Institute and FCO Science and Innovation Network

      • 新型シーケンサによる生物学へのビッグデータ解析時代の到来

        • 2012 / 7 / 6
        • 講演発表

        中村 保一

        岡山大学資源植物科学研究所　大麦・野生植物資源研究センターセミナー

      • New resources of DNA Data Bank of Japan： DDBJ Omics Archive and BioProject

        • 2012 / 5 / 24
        • 講演発表

        長崎 英樹, 望月 孝子, 児玉 悠一, 猿橋 智, 高木 利久, 大久保 公策, 神沼 英里, 中村 保一

        NGS現場の会 第2回研究会

      • Sequence Read Archive： explosive growth of sequencing data

        • 2012 / 5 / 24
        • 講演発表

        児玉 悠一, 野崎 亜沙美, 神沼 英里, 中村 保一, 小笠原 理, 大久保 公策, 高木 利久

        NGS現場の会 第2回研究会

      • NGS由来大量データレポジトリDRAと解析支援パイプラインの提供

        • 2012 / 5 / 9
        • 講演発表

        中村 保一

        理研シンポジウム・データ駆動型生命情報科学の挑戦

      • 高速DNAシークエンサ・アーカイブDBとクラウド計算資源利用法

        • 2012 / 3 / 29
        • 講演発表

        神沼 英里, 望月 孝子, 長崎 英樹, 児玉 悠一, 猿橋 智, 小笠原 理, 高木 利久, 大久保 公策, 中村 保一

        第121回日本育種会年会

      • DRA&DDBJパイプライン

        • 2012 / 3 / 24
        • 講演発表

        中村 保一

        新学術領域研究「ゲノム支援」情報解析講習会

      • DDBJのサービス紹介

        • 2012 / 3 / 2
        • 講演発表

        中村 保一

        NBDC主催統合データベース講習会：AJACS本郷11

      • DDBJ Sequence Read Archive and a cloud-computing based annotation tool for new-generation sequencing data

        • 2012 / 1 / 14
        • 講演発表

        長崎 英樹, 望月 孝子, 神沼 英里, 児玉 悠一, 猿橋 智, 高木 利久, 大久保 公策, 中村 保一

        The International Plant & Animal Genome XX Conference

      • 日本DNAデータバンク(DDBJ)での新規電算機システムによる超並列型シーケンサ由来の大規模塩基配列情報解析支援の試み

        • 2011 / 12 / 9
        • 講演発表

        中村 保一

        第12回IPABシンポジウム 2011年12月9日

      • New resources of DNA Data Bank of Japan： DDBJ Omics Archive and BioProject

        • 2011 / 12 / 2
        • 講演発表

        児玉 悠一, 野崎 亜沙美, 李 慶範, 真島 淳, 神沼 英里, 高木 利久, 大久保 公策, 中村 保一

        第34回日本分子生物学会年会

      • DDBJ created a new Web-based nucleotide sequence data submission tool, code name： D-easy

        • 2011 / 12 / 2
        • 講演発表

        小菅 武英, 真島 淳, 筒井 波留, 江嶋 真由美, 神沼 英里, 高木 利久, 大久保 公策, 中村 保一

        第34回日本分子生物学会年会

      • 新型シーケンサ・アーカイブ配列のクラウド型解析パイプラインDDBJ Pipeline進捗： de novoアセンブル配列注釈ワークフロー

        • 2011 / 12 / 2
        • 講演発表

        長崎 英樹, 望月 孝子, 児玉 悠一, 猿橋 智, 高木 利久, 大久保 公策, 神沼 英里, 中村 保一

        第34回日本分子生物学会年会

      • DDBJ Sequence Read Archive の紹介

        • 2011 / 12 / 2
        • 講演発表

        児玉 悠一

        第6回インフォマティクス情報交換会

      • DDBJ Sequence Read Archive and a cloud-computing based analytical pipeline for next-generation sequencing reads

        • 2011 / 11 / 28
        • 講演発表

        猿橋 智, 望月 孝子, 長崎 英樹, 児玉 悠一, 野崎 亜沙美, 李 慶範, 大城戸 利久, 横山 会美, 神沼 英里, 菅原 秀明, 大久保 公策, 高木 利久, 中村 保一

        SOL&ICuGI 2011： 8th Solanaceae and 2nd Cucurbitaceae Genome Joint Conference

      • 次世代シーケンサーデーターのDRA (DDBJ Sequence Read Archive) への登録

        • 2011 / 11 / 28
        • 講演発表

        児玉 悠一

        シーケンサー利用技術講習会 - 第7回ロシュ・ダイアグノスティックス社 Genome Sequencer jr編

      • DDBJ Read Annotation Pipeline 次世代シーケンサ由来配列データ解析パイプライン 解析目的別ワークフローの構築

        • 2011 / 10 / 9
        • 講演発表

        望月 孝子, 児玉 悠一, 猿橋 智, 長崎 英樹, 神沼 英里, 菅原 秀明, 大久保 公策, 高木 利久, 中村 保一

        「生命情報科学若手の会」第２回研究会

      • 日本DNAデータバンク (DDBJ)

        • 2011 / 10 / 5
        • 講演発表

        中村 保一, 小笠原理, 神沼 英里, 高木 利久, 大久保 公策

        トーゴーの日シンポジウム2011

      • 次世代シーケンサーのアーカイブDBとクラウド型データ解析システムの紹介

        • 2011 / 8 / 19
        • 講演発表

        神沼 英里

        第154回農林交流センターワークショップ

      • DDBJ Sequence Read Archive and a cloud-computing based annotation tool for next-generation sequencing data

        • 2011 / 7 / 10
        • 講演発表

        長崎 英樹, 望月 孝子, 児玉 悠一, 猿橋 智, 高木 利久, 大久保 公策, 神沼 英里, 中村 保一

        The 2nd International Conference on the Progress of “1000 Plant & Animal Reference Genomes Project”

      • DDBJ Read Annotation Pipeline： 新型シーケンサ由来配列のクラウド型解析パイプライン

        • 2011 / 5 / 28
        • 講演発表

        猿橋 智, 児玉 悠一, 李 慶範, 大城戸 利久, 横山 会美, 長崎 英樹, 望月 孝子, 神沼 英里, 菅原 秀明, 高木 利久, 大久保 公策, 中村 保一

        NGS 現場の会・第一回研究会

      • DDBJ Read Annotation Pipeline： 新型シーケンサ由来配列のクラウド型パイプライン

        • 2011 / 3 / 20
        • 講演発表

        長崎 英樹，望月 孝子，神沼 英里，渡邊 成樹，児玉 悠一，猿橋 智，菅原 秀明，高木 利久, 大久保 公策, 中村 保一

        第52回日本植物生理学会年会

      • DNA Data Bank of Japan ～新型シークエンサからのデータ登録・解析

        • 2011 / 3 / 14
        • 講演発表

        猿橋 智, 児玉 悠一, 李 慶範, 大城戸 利久, 横山 会美, 長崎 英樹, 望月 孝子, 神沼 英里, 菅原 秀明, 高木 利久, 大久保 公策, 中村 保一

        第5回日本ゲノム微生物学会年会

      • 新型シークエンサ配列解析のためのクラウド型計算機資源利用法

        • 2011 / 1 / 28
        • 講演発表

        神沼 英里

        東北大学グローバルCOE 第7回Network Medicine 特論

      • DDBJ Read Annotation Pipeline： A cloud based pipeline for high-throughput analysis of next generation sequencing data

        • 2011 / 1 / 15
        • 講演発表

        長崎 英樹, 望月 孝子, 渡邊 成樹, Morizaki, S., 児玉 悠一, 猿橋 智, 高木 利久, 大久保 公策, 神沼 英里, 中村 保一

        Plant and Animal Genome XIX Conference

      • DDBJ Read Annotation Pipeline： 新型シーケンサ由来配列のクラウド型パイプライン

        • 2011 / 12 / 8
        • 講演発表

        長崎 英樹, 望月 孝子, 渡邊 成樹, Morizaki, S., 児玉 悠一, 猿橋 智, 高木 利久, 大久保 公策, 神沼 英里, 中村 保一

        Plant and Animal Genome XIX Conference

      • DDBJ Sequence Read Archive / DDBJ Omics Archive

        • 2010 / 12 / 7
        • 講演発表

        児玉 悠一, 猿橋 智, 神沼 英里, 菅原 秀明, 高木 利久, 大久保 公策, 中村保一

        第33回日本分子生物学会年会

      • DDBJ Read Annotation Pipeline： A Cloud Computing Based Analytical Tool for Next-generation Sequencing Data

        • 2010 / 10 / 14
        • 講演発表

        中村 保一

        Biocuration 2010

      • DDBJ Sequence Read Archive / DDBJ Omics Archive

        • 2010 / 10 / 11
        • 講演発表

        児玉 悠一, 猿橋 智, 神沼 英里, 菅原 秀明, 高木 利久, 大久保 公策, 中村 保一

        4th Biocuration Conference

      • DDBJ Sequence Read Archive / DDBJ Omics Archive

        • 2010 / 10 / 5
        • 講演発表

        児玉 悠一, 猿橋 智, 神沼 英里, 菅原 秀明, 高木 利久, 大久保 公策, 中村 保一

        統合データベースプロジェクトシンポジウム「ライフサイエンスの未来へ?10年先のデータベースを考える?」

      • DDBJ Sequence Read Annotation Pipeline; A cloud computing-based analytical tool for next-generation sequencing data

        • 2010 / 9 / 15
        • 講演発表

        神沼 英里, 望月 孝子, 児玉 悠一, 猿橋 智, 菅原 秀明, 大久保 公策, 高木 利久, 中村 保一

        10th Cold Spring Harbor Laboratory/Wellcome Trust conference on Genome Informatics

      • 次世代シーケンサのアーカイブDBとクラウド型解析パイプライン

        • 2010 / 9 / 10
        • 講演発表

        神沼 英里, 望月 孝子, 児玉 悠一, 猿橋 智, 菅原 秀明, 大久保 公策, 高木 利久, 中村 保一

        第148回農林交流センターワークショップ 「次世代シーケンサーを利用したゲノム解析の実際」

      • Parsing the Legacy DDBJ-- old but new

        • 2010 / 8 / 9
        • 講演発表

        小笠原 理

        ライフサイエンス・データベース講習会 in 名大

      • DDBJの新型シーケンサへの対応 ― データアーカイブDRAと解析パイプライン

        • 2010 / 8 / 9
        • 講演発表

        中村 保一

        ライフサイエンス・データベース講習会 in 名大

      • DDBJ past and future

        • 2010 / 8 / 9
        • 講演発表

        大久保 公策

        ライフサイエンス・データベース講習会 in 名大

      • 次世代シークエンサの活用法/データの解析法

        • 2010 / 8 / 4
        • 講演発表

        中村 保一

        DBCLS講習会 AJACS21 みちのく

      • 次世代シーケンサーデータのDRA(DDBJ Read Archive)への登録

        • 2010 / 7 / 15
        • 講演発表

        児玉 悠一

        シーケンサー利用技術講習会 - 第3回ライフテクノロジーズジャパン社 SOLiDTM　Systems編

      • DDBJ Omics Archive and DDBJ Read Annotation Pipeline： archive and analyze quantitative data from next generation platforms

        • 2010 / 7 / 13
        • 講演発表

        児玉 悠一

        13th International MGED Meeting

      • DDBJ Read Annotation Pipeline： A web-based analytical tool for next-generation sequencing data

        • 2010 / 7 / 9
        • 講演発表

        神沼 英里, 望月 孝子, 児玉 悠一, 猿橋 智, 菅原 秀明, 大久保 公策, 高木 利久, 中村 保一

        18th Annual International Conference on Intelligent Systems for Molecular Biology(ISMB2010)

      • 次世代シーケンサのアーカイブDBとクラウド型解析パイプライン

        • 2010 / 7 / 2
        • 講演発表

        神沼 英里, 望月 孝子, 児玉 悠一, 猿橋 智, 菅原 秀明, 大久保 公策, 高木 利久, 中村 保一

        NIASシンポジウム「イネ遺伝学・分子生物学ワークショップ2010」

      • DDBJ Read Archive (DRA) の紹介

        • 2010 / 6 / 21
        • 講演発表

        児玉 悠一

        第309回 CBI 学会研究講演会

      • Plant SNP annotation using a web-based pipeline tool for next-generation sequencing data

        • 2010 / 6 / 7
        • 講演発表

        神沼 英里, 望月 孝子, 児玉 悠一, 猿橋 智, 菅原 秀明, 大久保 公策, 高木 利久, 中村 保一

        The 21th International Conference on Arabidopsis Research

      • 次世代シークエンサの活用法

        • 2010 / 6 / 4
        • 講演発表

        神沼 英里, 望月 孝子, 児玉 悠一, 猿橋 智, 菅原 秀明, 高木 利久, 大久保 公策, 中村 保一

        DBCLS 講習会 AJACS18

      • DDBJ Read Archive - Public archive for output data from next-generation sequencer

        • 2010 / 5 / 26
        • 講演発表

        猿橋 智, 児玉 悠一, 神沼 英里, 五條堀 孝, 高木 利久, 大久保 公策, 菅原 秀明, 中村 保一

        The 5th NIG Poster Workshop

      • 協調作業・共同研究コラボレーション・ツールとして Google Apps の DDBJ における利用例 ～DDBJ から NIG 全体への利用をめざして～

        • 2010 / 5 / 26
        • 講演発表

        小菅 武英, 望月 孝子, *渡邊 成樹, 真島 淳, 神沼 英里, 大久保 公策, 高木 利久, 中村 保一

        The 5th NIG Poster Workshop

      • A Cloud computing based Analysis System for the Next Generation sequencing Data

        • 2010 / 5 / 26
        • 講演発表

        望月 孝子, 神沼 英里, 児玉 悠一, 猿橋 智, 菅原 秀明, 大久保 公策, 高木 利久, 中村 保一

        The 5th NIG Poster Workshop

      • 次世代シークエンサデータのアーカイブ登録と解析パイプライン

        • 2010 / 3 / 19
        • 講演発表

        神沼 英里, 望月 孝子, 児玉 悠一, 猿橋 智, 菅原 秀明, 高木 利久, 大久保 公策, 中村 保一

        第51回日本植物生理学会年会 データベース講習会

      • 次世代シーケンサーデータの DRA(DDBJ Read Archive)への登録

        • 2010 / 2 / 18
        • 講演発表

        児玉 悠一

        第２回シーケンサー利用技術講習会 イルミナ社 Genome Analyzer（通称Solexa）編

      • 次世代シーケンサーデータのDRA(DDBJ Sequence Read Archive)への登録

        • 2009 / 12 / 17
        • 講演発表

        児玉 悠一

        第１回シーケンサー利用技術講習会 ロシュ・ダイアグノスティックス社 Genome Sequencer FLX System編

      • DDBJ Sequence Read Archive and DDBJ Read Annotation Pipeline： An archive database and an analytical tool for next-generation sequence data

        • 2009 / 12 / 14
        • 講演発表

        Eli Kaminuma, Yuichi Kodama, Satoshi Saruhashi, Takeshi Konno, Takako Mochizuki, Hidemasa Bono, Hideaki Sugawara, Kousaku Okubo, Toshihisa Takagi, Yasukazu Nakamura

        The 20th International Conference on Genome Informatics

      • Consecutive Update of the Microbial Genome Re-Annotation Database, GTPS

        • 2009 / 12 / 14
        • 講演発表

        Takehide Kosuge, Yasumasa Shigemoto, Yoshikazu Kuwana, Hideaki Sugawara

        The 20th International Conference on Genome Informatics

      • 次世代シーケンサーのハイスループット・データ解析システム「DDBJ Short Read Annotation Pipeline」の構築

        • 2009 / 12 / 9
        • 講演発表

        神沼 英里, 児玉 悠一, 大久保 公策, 高木 利久, 中村 保一

        第32回日本分子生物学会年会

      • 「DDBJ Sequence Read Archive」：次世代シークエンサーからの出力データのためのアーカイブ

        • 2009 / 12 / 9
        • 講演発表

        児玉 悠一,猿橋 智, 五條堀 孝, 舘野 義男, 神沼 英里, 中村 保一, 菅原 秀明

        第32回日本分子生物学会年会

      • DDBJにおける次世代シーケンサデータへの対応

        • 2009 / 12 / 1
        • 講演発表

        神沼 英里, 児玉 悠一, 望月 孝子, 猿橋 智, 中村 保一

        ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS) セミナー

      • DDBJ： 配列データのフロー

        • 2009 / 12 / 1
        • 講演発表

        真島 淳, 中村 保一

        ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS) セミナー

      • DNA Data Bank of Japan (DDBJ) の新展開

        • 2009 / 11 / 30
        • 講演発表

        神沼 英里, 中村 保一

        情報・システム研究機構シンポジム「情報とシステム2009」

      • 共同利用としてのライフサイエンス基盤－日本DNAデータバンク（DDBJ）とライフサイエンス統合データベース（LSDB）

        • 2009 / 11 / 31
        • 講演発表

        五條堀 孝

        情報・システム研究機構シンポジム「情報とシステム2009」

      • DDBJ Sequence Read Archiveのご紹介（新型シークエサへの対応）

        • 2009 / 11 / 17
        • 講演発表

        猿橋 智, 児玉 悠一, 神沼 英里, 五條堀 孝, 舘野 義男, 中村 保一, 菅原 秀明

        バイオインフォマティクス推進センター事業（BIRD）第5回研究開発成果報告会

      • Systematic Organization of Gene Expression Data in Japan

        • 2009 / 10 / 5
        • 講演発表

        坊農 秀雅, 神沼 英里, 児玉 悠一, 中村 保一, 大久保 公策, 高木 利久

        12th International MGED Meeting

      • CIBEX

        • 2009 / 10 / 5
        • 講演発表

        児玉 悠一, 舘野 義男, 池尾 一穂

        12th International MGED Meeting

      • 遺伝子データバンクについて（DNA Data Bank of Japan, DDBJ）

        • 2009 / 8 / 19
        • 講演発表

        李 慶範

        Korean Bioinformation Center (KOBIC) セミナー

      • DDBJ Sequence Read Archive

        • 2009 / 8 / 6
        • 講演発表

        児玉 悠一

        理化学研究所 横浜研究所 所内セミナー

      • Short Readデータ解析例の紹介

        • 2009 / 8 / 4
        • 講演発表

        神沼 英里

        ライフサイエンス統合データベースセンター(DBCLS) セミナー

      • DDBJ Sequence Read Archive

        • 2009 / 6 / 26
        • 講演発表

        児玉 悠一

        第23回システムバイオロジー研究会

      • DNA Data Bank of Japan (DDBJ)

        • 2009 / 6 / 12
        • 講演発表

        神沼 英里, 中村 保一, 高木 利久

        統合データベースプロジェクト シンポジウム 2009「データベースが拓くこれからのライフサイエンス」

      • 次世代シークエンサの出力データのためのアーカイブについて

        • 2009 / 6 / 12
        • 講演発表

        児玉 悠一, 猿橋 智, 五條堀 孝, 舘野 義男, 中村 保一, 菅原秀明

        統合データベースプロジェクト シンポジウム 2009「データベースが拓くこれからのライフサイエンス」

      • Constructing a high-throughput annotation pipeline of next generation sequencing reads

        • 2009 / 5 / 26
        • 講演発表

        神沼 英里, 中村 保一, 高木 利久

        遺伝学研究所内部交流セミナー The 4th NIG Poster Workshop

      • 次世代シークエンサの出力データのためのアーカイブについて

        • 2009 / 5 / 26
        • 講演発表

        児玉 悠一, 猿橋 智, 五條堀 孝, 舘野 義男, 中村 保一, 菅原 秀明

        遺伝学研究所内部交流セミナー The 4th NIG Poster Workshop

      • DDBJ Activities： Contribution to the Research in Information Biology

        • 2009 / 4 / 16
        • 講演発表

        真島 淳, 小菅 武英, 大城戸 利久, 児玉 悠一, 池尾 一穂, 菅原 秀明, 舘野 義男, 五條堀 孝

        The 3rd International Biocuration Conference

      • RNA-Seqデータ解析　WETラボのための鉄板レシピ (実験医学別冊)(Chapter 9論文投稿に必須! データを登録・公開する)

        • 2019 / 12
        • 出版物

        児玉 悠一

        羊土社

      • 研究,健康,医療を支えるデータベース

        • 2018
        • 出版物

        児玉 悠一

        バイオミディア 第96巻 第2号

      • 研究開発の俯瞰報告書(p528-538) ライフサイエンス・臨床医学分野（2017年）

        • 2017 / 3
        • 出版物

        児玉 悠一, 真島 淳, 高木 利久

        国立研究開発法人 科学技術振興機構 (JST) 研究開発戦略センター

      • 実験医学別冊 次世代シークエンス解析スタンダード NGSのポテンシャルを活かしきるWET&DRY（二階堂 愛／編）

        • 2014 / 8
        • 出版物

        小笠原 理, 長崎 英樹, 望月 孝子, 谷沢 靖洋, 神沼 英里, 中村 保一, 児玉 悠一, 真島 淳, 高木 利久

        羊土社

      • 実験医学増刊　Vol.32 No.20 今日から使える！データベース・ウェブツール 達人になるための実践ガイド100（内藤雄樹／編）

        • 2014 / 7
        • 出版物

        高木 利久, 中村 保一, 児玉 悠一, 藤澤 貴智, 小笠原 理, 長崎 英樹

        羊土社

      • 細胞工学別冊 次世代シークエンサー 目的別アドバンストメソッド（菅野純夫・鈴木穣／監修）

        • 2012 / 12 / 19
        • 出版物

        中村 保一, 神沼 英里, 児玉 悠一, 福田 亜沙美, 長崎 英樹, 望月 孝子

        学研メディカル秀潤社

      • 実験医学増刊　Vol.29 No.15 使えるデータベース・ウェブツール 日本発のデータベース戦略から，ゲノム・疾患情報の有効活用まで（有田正規／編）

        • 2011 / 9
        • 出版物

        高木 利久, 中村 保一, 小笠原 理, 神沼 英里, 菅原 秀明, 大久保 公策

        羊土社

      • 細胞工学　Vol.30 No.8 次世代シークエンサーを使いこなす 目的別解析法からデータ処理まで

        • 2011 / 7 / 22
        • 出版物

        神沼 英里, 中村 保一

        学研メディカル秀潤社

      • 化学と生物vol.49, No.3 セミナー室 クラウド型計算機資源利用に基づいた新型DNAシークエンサ大量配列解析

        • 2011 / 3
        • 出版物

        神沼 英里, 中村 保一

        日本農芸化学会

      • 2023年度

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      • 第15回 INSDC meeting report 2002年5月20-22日 静岡県三島市

        • 2002/05/20
        • INSDC meeting report
        2002

      • 第16回 INSDC meeting report 2003年5月19-21日 米国ベセスダ

        • 2003/05/19
        • INSDC meeting report
        2003

      • 第17回 INSDC meeting report 2004年5月17-19日 英国ヒンクストン

        • 2004/05/17
        • INSDC meeting report
        2004

      • 第18回 INSDC meeting report 2005年5月16-18日 静岡県三島市

        • 2005/05/16
        • INSDC meeting report
        2005

      • 第19回 INSDC meeting report 2006年5月15-17日 米国ベセスダ

        • 2006/05/15
        • INSDC meeting report
        2006

      • 第20回 INSDC meeting report 2007年5月21-23日 英国ヒンクストン

        • 2007/05/21
        • INSDC meeting report
        2007

      • 第21回 INSDC meeting report 2008年5月20-22日 静岡県三島市

        • 2008/05/20
        • INSDC meeting report
        2008

      • 第22回 INSDC meeting report 2009年5月12-15日 米国ベセスダ

        • 2009/05/12
        • INSDC meeting report
        2009

      • 第23回 INSDC meeting report 2010年5月19-21日 英国ヒンクストン

        • 2010/05/19
        • INSDC meeting report
        2010

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        • 2011/05/23
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        2011

      • 第25回 INSDC meeting report 2012年6月11-13日 米国ベセスダ

        • 2012/06/11
        • INSDC meeting report
        2012

      • 第26回 INSDC meeting report 2013年5月21-23日 英国ヒンクストン

        • 2013/05/21
        • INSDC meeting report
        2013

      • 第27回 INSDC meeting report 2014年5月20-22日 静岡県三島市

        • 2014/05/10
        • INSDC meeting report
        2014

      • 第28回 INSDC meeting report 2015年5月19-21日 米国ベセスダ

        • 2015/05/19
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        2015

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        • 2016/05/16
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        2016

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        2018

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        • 2019/05/15
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        2019

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        2020

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        • 2022/05/23
        • INSDC meeting report
        第35回 INSDC meeting report 2022年5月23～27日 teleconference

      • 第36回 INSDC meeting report 2023年5月23～25日 静岡県三島市

        • 2023/05/23
        • INSDC meeting report
        第36回 INSDC meeting report 2023年5月23～25日 静岡県三島市

      • 第37回 INSDC meeting report 2024年6月4～6日 米国ベセスダ

        • 2024/06/04
        • INSDC meeting report
        第37回 INSDC meeting report 2024年6月4～6日 米国ベセスダ